Bibliothèques prédéfinies Illumina
Caractéristiques
●Plateformes :Illumina NovaSeq 6000 et NovaSeq X Plus
●Modes de séquençage :PE150 et PE250
●Contrôle qualité des librairies avant séquençage
●Contrôle qualité et livraison des données de séquençage :livraison du rapport QC et des données brutes au format fastq après démultiplexage et filtrage des lectures Q30
Avantages des services
●Polyvalence des services de séquençage :le client peut choisir de séquencer par voie, Flow Cell ou par quantité de données requise (séquençage partiel de voie).
●Vaste expérience sur la plateforme de séquençage Illumina :avec des milliers de projets clôturés avec diverses espèces.
●Remise du rapport de contrôle qualité de séquençage :avec des mesures de qualité, l’exactitude des données et la performance globale du projet de séquençage.
●Processus de séquençage mature :avec un délai d'exécution court.
●Contrôle qualité rigoureux: nous mettons en œuvre des exigences strictes en matière de contrôle qualité pour garantir la fourniture de résultats de haute qualité constante.
Exemples de plates-formes
| Plate-forme | Cellule à circulation | Mode séquençage | Unité | Production estimée |
| NovaSeqX | 10B (8 voies) | PE150 | Voie unique Voie partielle | 375 Go/voie |
| 25B (8 voies) | PE150 | Voie unique Voie partielle | 1 000 Go/voie | |
| NovaSeq 6000 | Cellule à circulation SP (2 voies) | PE250 | Cellule à circulation Voie unique Voie partielle | 325-400 M de lectures/voie |
| Cellule à circulation S4 (4 voies) | PE150 | Cellule à circulation Voie unique Voie partielle | ~800 Go/voie |
Exemples d'exigences
| Quantité de données (X) | Concentration (qPCR/nM) | Volume | |
| Séquençage partiel des voies
| X ≤ 10 Go | ≥ 1 nM | ≥ 25 µl |
| 10 Go < X ≤ 50 Go | ≥ 2 nM | ≥ 25 µl | |
| 50 Go < X ≤ 100 Go | ≥ 3 nM | ≥ 25 µl | |
| X > 100 Go | ≥ 4 nM | ≥ 25 µl | |
| Séquençage des voies | Par voie | ≥ 1,5 nM / Pool de bibliothèques | ≥ 25 μl / Pool bibliothèque |
En plus de la concentration et de la quantité totale, une configuration de pic appropriée est également requise.
Remarque : le séquençage des voies des bibliothèques à faible diversité nécessite une entrée PhiX pour garantir un appel de base robuste.
Nous vous recommandons de soumettre des bibliothèques pré-regroupées comme exemples. Si vous avez besoin de BMKGENE pour effectuer un regroupement de bibliothèques, veuillez vous référer à
les exigences de la bibliothèque pour le séquençage partiel des voies.
Taille de la bibliothèque (carte des pics)
Le pic principal devrait se situer entre 300 et 450 pb.
Les bibliothèques doivent avoir un seul pic principal, aucune contamination par l'adaptateur et aucun dimère d'amorce.
Veuillez nous contacter si vos échantillons ne répondent pas aux exigences en matière de matière première.
Flux de travail des services
Contrôle qualité de la bibliothèque
Séquençage
Contrôle de la qualité des données
Livraison du projet
Rapport de contrôle qualité de la bibliothèque
Un rapport sur la qualité de la bibliothèque est fourni avant le séquençage, l'évaluation de la quantité de la bibliothèque et la fragmentation.
Rapport de contrôle qualité de séquençage
Tableau 1. Statistiques sur les données de séquençage.
| ID de l'échantillon | BMKID | Lectures brutes | Données brutes (pb) | Lectures propres (%) | Q20(%) | Q30(%) | CG(%) |
| C_01 | BMK_01 | 22 870 120 | 6 861 036 000 | 96.48 | 99.14 | 94,85 | 36,67 |
| C_02 | BMK_02 | 14 717 867 | 4 415 360 100 | 96.00 | 98,95 | 93,89 | 37.08 |
Figure 1. Répartition de la qualité selon les lectures dans chaque échantillon
Figure 2. Distribution du contenu de base
Figure 3. Répartition des contenus lus dans les données de séquençage
