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Produits

Séquençage d'immunoprécipitation de la chromatine (ChIP-seq)

L'immunoprécipitation de la chromatine (CHIP) est une technique qui exploite les anticorps pour enrichir sélectivement les protéines liant l'ADN et leurs cibles génomiques correspondantes. Son intégration avec NGS permet le profilage à l'échelle du génome des cibles d'ADN associées à la modification des histones, aux facteurs de transcription et à d'autres protéines de liaison à l'ADN. Cette approche dynamique permet des comparaisons de sites de liaison entre divers types de cellules, tissus ou conditions. Les applications de ChIP-Seq s'étendent de l'étude de la régulation transcriptionnelle et des voies de développement à l'élucidation des mécanismes de la maladie, ce qui en fait un outil indispensable pour comprendre les paysages de la régulation génomique et faire progresser les connaissances thérapeutiques.

Plateforme : Illumina NovaSeq


Détails des services

Bioinformatique

Résultats de la démonstration

Avantages des services

Analyse bioinformatique avancée et annotation complète :Nous utilisons plusieurs bases de données pour annoter fonctionnellement les gènes associés aux régions de liaison protéine-ADN, fournissant ainsi des informations sur les processus cellulaires et moléculaires sous-jacents à l'interaction.

Assistance après-vente :Notre engagement s'étend au-delà de l'achèvement du projet avec une période de service après-vente de 3 mois. Pendant cette période, nous proposons un suivi de projet, une assistance au dépannage et des séances de questions-réponses pour répondre à toute question liée aux résultats.

Expérience étendue :Forte d’une expérience dans la réalisation réussie de nombreux projets ChIP-Seq, notre société apporte plus d’une décennie d’expertise. Notre équipe d’analyse hautement qualifiée, associée à un contenu complet et à un support après-vente, garantit le succès de vos projets.

● Contrôle qualité rigoureux: Nous mettons en œuvre des points de contrôle de base à toutes les étapes, de la préparation des échantillons et des bibliothèques au séquençage et à la bioinformatique. Ce suivi méticuleux garantit la fourniture de résultats constants de haute qualité.

Spécifications des services

Bibliothèque

Stratégie de séquençage

Sortie de données recommandée

Contrôle de qualité

ADN purifié après immunoprécipitation

Illumina PE150

10 Go

Q30≥85 %

Conversion du bisulfite > 99 %

Efficacité de coupe MspI > 95 %

Exemples d'exigences

Quantité totale : ≥10 ng

Distribution de la taille des fragments : 100-750 bps

Flux de travail des services

livraison d'échantillon

Livraison d'échantillon

Préparation de la bibliothèque

Construction d'une bibliothèque

Séquençage

Séquençage

Analyse des données

Analyse des données

Services après-vente

Services après-vente


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  • Photo 91

    Comprend l’analyse suivante :

    ● Contrôle qualité des données brutes

    ● Appel de pic basé sur la cartographie du génome de référence

    ● Annotation des gènes associés aux pics

    ● Analyse de motifs : identification des sites de liaison aux facteurs de transcription (TFBS)

    ● Analyse différentielle des pics et annotation

    Évaluation de l'enrichissement à proximité des sites de départ de la transcription (TSS)

     

    photo 92

     

    Distribution à l'échelle du génome des pics CHIP

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    Classification des régions de pointe

    photo 94

    Enrichissement fonctionnel des gènes liés au pic (KEGG)

    photo95

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