Lämpökartta -laatikkoa käytetään lämpökartan piirtämiseen, joka voi suodattaa, normalisoida ja klusterimatriisitiedot.Sit käytetään enimmäkseen geeniekspressiotason klusterianalyysiin eri näytteiden välillä.
Biologisten funktioiden kiinnittäminen fasta -tiedostoihin sekvensseihin kohdistamalla sekvenssit tietokantaan, mukaan lukien NR, KEGG, COG, Swissprot, Trembl, KOG, PFAM.
BLAST (Paikallinen kohdistushakutyökalu) on algoritmi ja ohjelma löytääkseen alueita, joilla on samanlaiset biologiset sekvenssit. Se vertaa näitä sekvenssejä sekvenssiin datbaseihin ja laskee tilastollisen merkitsevyyden. Räjähdys koostuu neljästä työkalutyypistä, jotka perustuvat sekvenssityyppiin: BLASTN, LASTP, BLASTX ja TBLASTN.