-
BMKMANU S3000_Spatial Transcriptome
Spatiaalinen transkriptomiikka on tieteellisen innovaation eturintamassa, ja se antaa tutkijoille mahdollisuuden syventyä monimutkaisiin geenien ilmentymismalleihin kudoksissa säilyttäen samalla niiden avaruudellisen kontekstin. BMKGene on kehittänyt useille eri alustoille BMKManu S3000 Spatial Transcriptome Chip -sirun, jonka resoluutio on parannettu 3,5 µm, joka saavuttaa solunvälisen alueen ja mahdollistaa monitasoiset resoluutioasetukset. S3000-siru, jossa on noin 4 miljoonaa täplää, käyttää mikrokuoppia, jotka on kerrostettu helmillä, jotka on ladattu spatiaalisesti viivakoodatuilla sieppausantureilla. cDNA-kirjasto, joka on rikastettu spatiaalisilla viivakoodeilla, valmistetaan S3000-sirusta ja sekvensoidaan sen jälkeen Illumina NovaSeq -alustalla. Tilallisesti viivakoodattujen näytteiden ja UMI:iden yhdistelmä varmistaa tuotettujen tietojen tarkkuuden ja tarkkuuden. BMKManu S3000 -siru on erittäin monipuolinen ja tarjoaa monitasoisia resoluutioasetuksia, jotka voidaan hienosäätää eri kudoksille ja halutuille yksityiskohdille. Tämä mukautumiskyky asettaa sirun erinomaiseksi valinnaksi erilaisiin spatiaalisen transkriptomiikan tutkimuksiin, mikä varmistaa tarkan spatiaalisen klusteroinnin minimaalisella kohinalla. Solusegmentointiteknologian käyttö BMKManu S3000:n kanssa mahdollistaa transkriptiotietojen rajaamisen solujen rajoihin, jolloin tuloksena on suora biologinen merkitys. Lisäksi S3000:n parannettu resoluutio johtaa korkeampaan määrään geenejä ja UMI:ita, jotka havaitaan solua kohden, mikä mahdollistaa paljon tarkemman analyysin spatiaalisista transkriptiokuvioista ja solujen klusteroinnista.
-
DNBSEQ-valmiit kirjastot
MGI:n kehittämä DNBSEQ on innovatiivinen NGS-tekniikka, joka on onnistunut alentamaan sekvensointikustannuksia entisestään ja lisäämään läpimenoa. DNBSEQ-kirjastojen valmistaminen sisältää DNA:n fragmentoinnin, ssDNA:n valmistamisen ja pyörivän ympyrän monistamisen DNA-nanopallojen (DNB) saamiseksi. Nämä ladataan sitten kiinteälle pinnalle ja sekvensoidaan sen jälkeen kombinatorisella koetin-ankkurisynteesillä (cPAS). DNBSEQ-teknologia yhdistää alhaisen vahvistusvirhesuhteen edut korkeatiheyksisten virhekuvioiden käyttöön nanopalloilla, mikä johtaa sekvensointiin, jolla on suurempi suorituskyky ja tarkkuus.
Valmiiksi tehtyjen kirjastojen sekvensointipalvelumme avulla asiakkaat voivat valmistaa Illumina-sekvensointikirjastoja erilaisista lähteistä (mm. mRNA, koko genomi, amplikoni, 10x-kirjastot, mm.), jotka muunnetaan laboratorioissamme MGI-kirjastoiksi sekvensoitaviksi DNBSEQ-T7:ssä, mikä mahdollistaa suuret datamäärät pienemmillä kustannuksilla.
-
Hi-C-pohjainen kromatiinivuorovaikutus
Hi-C on menetelmä, joka on suunniteltu sieppaamaan genominen konfiguraatio yhdistämällä läheisyyteen perustuvia vuorovaikutuksia ja korkean suorituskyvyn sekvensointia. Menetelmä perustuu kromatiinin silloittamiseen formaldehydillä, jota seuraa pilkkominen ja uudelleenligaatio siten, että vain kovalenttisesti kytketyt fragmentit muodostavat ligaatiotuotteita. Sekvensoimalla nämä ligaatiotuotteet on mahdollista tutkia genomin 3D-organisaatiota. Hi-C mahdollistaa genomin kevyesti pakautuneiden (A-osastot, eukromatiini) ja todennäköisemmin transkriptionaalisesti aktiivisten osien ja tiiviimmin pakattujen alueiden (B-osastot, heterokromatiini) jakauman tutkimisen. Hi-C:tä voidaan käyttää myös paikantamaan topologisesti assosioituneita domeeneja (TAD), genomin alueita, joilla on laskostuneet rakenteet ja joilla on todennäköisesti samanlaiset ilmentymismallit, ja tunnistamaan kromatiinisilmukoita, DNA-alueita, jotka ovat kiinnittyneet yhteen proteiineihin ja jotka ovat usein rikastettu sääntelyelementeillä. BMKGenen Hi-C-sekvensointipalvelu antaa tutkijoille mahdollisuuden tutkia genomiikan spatiaalisia ulottuvuuksia ja avata uusia mahdollisuuksia ymmärtää genomin säätelyä ja sen vaikutuksia terveyteen ja sairauksiin.
-
TGuide Smart Magnetic Plant RNA Kit
TGuide Smart Magnetic Plant RNA Kit
Puhdista korkealaatuinen kokonais-RNA kasvikudoksista
-
TGuide Smart Blood/Cell/Tissue RNA Kit
TGuide Smart Blood/Cell/Tissue RNA Kit
Esitäytetty patruuna/levyreagenssisarja korkeatuottoisen, erittäin puhtaan, korkealaatuisen, inhibiittorivapaan kokonais-RNA:n puhdistamiseen eläinkudoksesta/solusta/tuoresta kokoverestä
-
TGuide Smart Magnetic Plant DNA Kit
TGuide Smart Magnetic Plant DNA Kit
Puhdista korkealaatuinen genominen DNA eri kasvikudoksista
-
TGuide Smart Soil / Stool DNA Kit
TGuide Smart Soil / Stool DNA Kit
Puhdistaa erittäin puhtaan ja laadukkaan inhibiittorivapaan DNA:n maa- ja ulostenäytteistä
-
TGuide Smart DNA -puhdistussarja
Palauttaa korkealaatuisen DNA:n PCR-tuotteesta tai agaroosigeeleistä.
-
TGuide Smart Blood Genomic DNA Kit
TGuide Smart Blood Genomic DNA Kit
Esitäytetty patruuna/levyreagenssisarja genomisen DNA:n puhdistamiseen verestä ja buffy coatista
-
TGuide Smart Magnetic Tissue DNA Kit
Esitäytetty patruuna/levyreagenssisarja genomisen DNA:n erottamiseen eläinkudoksista
-
TGuide Smart Universal DNA Kit
Esitäytetty patruuna/levyreagenssisarja genomisen DNA:n puhdistamiseen verestä, kuivuneesta veripisteestä, bakteereista, soluista, syljestä, vanupuikoista, eläinkudoksista jne.
-
TGuide S16 Nukleiinihappouutto
TGuide S16 Nukleiinihappouutto
Helppokäyttöinen pöytäinstrumentti, 1-8 tai 16 näytettä samaan aikaan
Luettelonumero / pakkaus
Kissa. ei
ID
Valmistelujen määrä
OSE-S16-AM
1 setti
-
PacBio 2+3 täyspitkä mRNA-liuos
Vaikka NGS-pohjainen mRNA-sekvensointi on monipuolinen työkalu geenin ilmentymisen kvantifiointiin, sen riippuvuus lyhyistä lukemista rajoittaa sen tehokkuutta monimutkaisissa transkriptomisissa analyyseissä. Toisaalta PacBio-sekvensointi (Iso-Seq) käyttää pitkään luettua tekniikkaa, joka mahdollistaa täysimittaisten mRNA-transkriptien sekvensoinnin. Tämä lähestymistapa helpottaa vaihtoehtoisten silmukointien, geenifuusioiden ja polyadenylaation kattavaa tutkimista, vaikka se ei ole ensisijainen valinta geeniekspression kvantifiointiin. 2+3-yhdistelmä kattaa eron Illuminan ja PacBion välillä luottamalla PacBio HiFi -lukemiin transkriptioisoformien täydellisen sarjan tunnistamiseksi ja NGS-sekvensoinnilla identtisten isoformien kvantifioimiseksi.
Alustat: PacBio Sequel II/ PacBio Revio ja Illumina NovaSeq;
