Exclusive Agency for Korea

条形banneri-03

Uutiset

GENOME

Nature_Communications_Logo

Biomassasadon Miscanthus lutarioriparius -genomin kromosomimittakaavainen kokoonpano ja analyysi

Nanopore-sekvensointi | Illumina | Hi-C | RNA-sekvensointi | Fylogeny

Tässä tutkimuksessa Biomarker Technologies tarjosi teknistä tukea Nanopore-sekvensoinnille, de novo -genomin kokoonpanolle, Hi-C-avusteiselle kokoonpanolle jne.

Abstrakti

Miscanthus, juurakoinen monivuotinen kasvi, jolla on suuret mahdollisuudet bioenergian tuotantoon sen korkean biomassan ja stressinsietokyvyn vuoksi. Raportoimme kromosomimittakaavaisen kokoonpanonMiscanthus lutarioripariusgenomia yhdistämällä Oxford Nanopore -sekvensointi ja Hi-C-teknologiat. 2,07 Gb:n kokoonpano kattaa 96,64 % genomista ja N50:n jatkuvuus on 1,71 Mb. Sentromeeri- ja telomeerisekvenssit kootaan kaikille 19 kromosomille ja kromosomille 10, vastaavasti. M. lutarioripariuksen allotetraploidinen alkuperä varmistetaan käyttämällä sentromeerisiä satelliittitoistoja. Tetraploidinen genomirakenne ja useat kromosomaaliset uudelleenjärjestelyt suhteessa durraan ovat selvästi osoitettu. Tandem-kaksoisgeenitM. lutarioripariusovat toiminnallisesti rikastettuja paitsi stressivasteeseen, myös soluseinän biosynteesiin liittyvien termien suhteen. Taudin vastustuskykyyn, soluseinän biosynteesiin ja metalli-ionien kuljetukseen liittyvät geeniperheet ovat laajentuneet ja kehittyneet suuresti. Näiden perheiden laajentaminen voi olla tärkeä genomiperusta, jolla parannetaan merkittäviä ominaisuuksiaM. lutarioriparius.

Genomin kokoonpanon keskeiset tilastot

uutiset-1
uutiset-2

Kuva. M. lutarioripariuksen genomikokoonpanon yleiskatsaus

Uutisia ja kohokohtia tavoitteena on jakaa uusimmat onnistuneet tapaukset Biomarker Technologiesin kanssa, vangita uusia tieteellisiä saavutuksia sekä tutkimuksen aikana käytettyjä merkittäviä tekniikoita.


Postitusaika: 05.01.2022

Lähetä viestisi meille: