Transkripti on yhteys genomisen geneettisen tiedon ja biologisen toiminnan proteomin välillä. Transkription tason säätely on organismien tärkein ja yleisimmin tutkittu säätelytapa. Transkriptomekvensointi voi sekvenssoida transkriptomin missä tahansa ajankohdassa tai missä tahansa olosuhteessa, resoluutiolla, joka on tarkka yhdelle nukleotidille. Se voi dynaamisesti heijastaa geenitranskription tasoa, tunnistaa samanaikaisesti ja kvantifioida harvinaiset ja normaalit transkriptit ja tarjota rakennetietoa siitä näytteen spesifiset transkriptit.
Tällä hetkellä transkriptomekvenssitekniikkaa on käytetty laajasti maatalouden, lääketieteen ja muiden tutkimusalueilla, mukaan lukien eläinten ja kasvien kehityksen säätely, ympäristön sopeutuminen, immuunivuorovaikutus, geenin lokalisointi, lajien geneettinen evoluutio sekä kasvaimen ja geneettisen sairauden havaitseminen.
