Genomin laajuisen assosiaatiotutkimuksen (GWAS) tavoitteena on tunnistaa geneettiset variantit (genotyyppi), jotka liittyvät spesifisiin piirteisiin (fenotyyppi). GWA-tutkimukset tutkivat geneettisiä markkereita, jotka ylittävät suuren määrän yksilöiden kokonaisen genomin ja ennustavat genotyyppifenotyyppien assosiaatiot tilastollisella analyysillä populaatiotasolla. Koko sukupolven uudelleenmuokkaus voi mahdollisesti löytää kaikki geneettiset variantit. Yhdistettynä fenotyyppisiin tietoihin GWA: t voidaan prosessoida fenotyyppiin liittyvien SNP: ien, QTL: ien ja ehdokasgeenien tunnistamiseksi, jotka tukevat voimakkaasti nykyaikaista eläin-/kasvien jalostusta. SLAF on itse kehittynyt yksinkertaistettu genomisekvensointistrategia, joka löytää genomin laajuiset hajautetut markkerit, SNP. Nämä SNP: t, molekyylisinä geenimarkkereina, voidaan prosessoida assosiaatiotutkimuksiin kohdennettujen piirteiden kanssa. Se on kustannustehokas strategia monimutkaisten piirteiden tunnistamisessa liittyviin geneettisiin variaatioihin.
