DNBSEQ-valmiit kirjastot
Ominaisuudet
●Alusta:MGI-DNBSEQ-T7
●Sekvensointitilat:PE150
●Illumina-kirjastojen siirto osoitteeseenMGI:mahdollistaa suurten tietomäärien sekvensoinnin alhaisin kustannuksin.
●Kirjastojen laadunvalvonta ennen sekvensointia.
●Sekvensointitietojen laadunvalvonta ja toimitus:QC-raportin ja raakadatan toimitus fastq-muodossa demultipleksoinnin ja Q30-lukujen suodatuksen jälkeen.
Edut
●Sekvensointipalveluiden monipuolisuus:asiakas voi valita järjestyksen kaistan tai datamäärän mukaan.
●Suuri datatulostus:1500 Gb/kaista
●Sekvensoinnin laadunvalvontaraportin toimitus:laatumittareiden, tietojen tarkkuuden ja sekvensointiprojektin yleisen suorituskyvyn kanssa.
●Aikuinen sekvensointiprosessi:lyhyellä läpimenoajalla.
●Tiukka laadunvalvonta: Noudatamme tiukkoja laadunvalvontavaatimuksia varmistaaksemme jatkuvasti korkealaatuisten tulosten toimituksen.
Esimerkkivaatimukset
| Tietojen määrä (X) | Pitoisuus (qPCR/nM) | Äänenvoimakkuus | |
| Osittainen kaista
| X ≤ 10 Gb | ≥ 1 nM | ≥ 25 μl |
| 10 Gb < X ≤ 50 Gb | ≥ 2 nM | ≥ 25 μl | |
| 50 Gb < X ≤ 100 Gb | ≥ 3 nM | ≥ 25 μl | |
| X > 100 Gb | ≥ 4 nM | ||
| Yksikaistainen | Per Lane | ≥ 1,5 nM / kirjastopooli | ≥ 25 μl / kirjastoallas |
Konsentraation ja kokonaismäärän lisäksi tarvitaan myös sopiva huippukuvio.
Huomautus: Mataladiversiteettikirjastojen kaistan sekvensointi vaatii PhiX-piikkiin, jotta varmistetaan vankka peruskutsu.
Suosittelemme esipoolattujen kirjastojen lähettämistä näytteinä. Jos tarvitset BMKGENEä kirjastojen yhdistämiseen, katso
kirjastovaatimukset osittaiselle kaistasekvenssille.
Kirjaston koko (huippukartta)
Päähuipun tulee olla 300–450 bp:n sisällä.
Kirjastoissa tulisi olla yksi pääpiikki, ei adapterin kontaminaatiota eikä alukedimeerejä.
Palvelun työnkulku
Kirjaston laadunvalvontaraportti
Raportti kirjaston laadusta tarjotaan ennen sekvensointia, kirjaston määrän ja pirstoutumisen arviointia.
Sekvensointi QC-raportti
Taulukko 1. Sekvensointitietojen tilastot.
| Esimerkki ID | BMKID | Raakoja lukemia | Raakadata (bp) | Puhtaat lukemat (%) | Q20 (%) | Q30 (%) | GC (%) |
| C_01 | BMK_01 | 22 870 120 | 6 861 036 000 | 96,48 | 99.14 | 94,85 | 36,67 |
| C_02 | BMK_02 | 14 717 867 | 4,415,360,100 | 96.00 | 98,95 | 93,89 | 37.08 |
Kuva 1. Laatujakauma kunkin näytteen lukemien mukaan
Kuva 2. Perussisällön jakelu
Kuva 3. Lukujen sisällön jakautuminen sekvensointitiedoissa
