Circrna

Pyöreät RNA: t (CirCRNA: t) ovat koodaamattomia RNA: ita, jotka muodostavat ympyrärakenteita ja joilla on useita säätelyrooleja, mukaan lukien kilpailu miRNA: n kanssa kohdegeenien ja proteiinien sitoutumisen suhteen. BMKCLOUD CIRCRNA -putkisto on suunniteltu rRNA: n ehtyneiden kirjastojen analysointiin, jolla on hyvin merkitty ja korkealaatuinen vertailugenomi. Analyysi alkaa lukemisen trimmauksen ja laadunvalvonnasta, jota seuraavat kohdistaminen referenssigenomiin ja uusien CIRCRNA: ien ennustaminen yhdistettynä tietokantojen tunnettujen CIRCRNA: ien tunnistamiseen. Vastaavat miRNA -kohteet ja circRNA -isännät tunnistetaan myöhemmin. Differentiaalinen ekspressioanalyysi paljastaa erilaisesti ekspressoidut sircRNA: t, ja vastaavat isännät on toiminnallisesti merkitty rikastettujen biologisten toimintojen purkamiseen.