RNA های کوچک نوع RNA غیر کد کننده کوتاه با طول متوسط 18-30 نانومتر از جمله miRNA ، siRNA و پیرنا هستند. این RNA های کوچک به طور گسترده گزارش شده است که در فرآیندهای مختلف بیولوژیکی مانند تخریب mRNA ، مهار ترجمه ، تشکیل هتروکروماتین و غیره دخیل است. تجزیه و تحلیل توالی SmallRNA به طور گسترده ای در مطالعات مربوط به رشد حیوانات/گیاهان ، بیماری ، ویروس و غیره اعمال شده است. RNA کوچک RNA پلت فرم تجزیه و تحلیل توالی شامل تجزیه و تحلیل استاندارد و کاوی داده پیشرفته است. بر اساس داده های RNA-SEQ ، تجزیه و تحلیل استاندارد می تواند به شناسایی و پیش بینی miRNA ، پیش بینی ژن هدف miRNA ، حاشیه نویسی و تجزیه و تحلیل بیان دست یابد. تجزیه و تحلیل پیشرفته امکان جستجوی و استخراج miRNA سفارشی ، تولید نمودار ون ، miRNA و ایجاد شبکه ژن هدف را فراهم می کند.