رونوشت تمام قد Pacbio

PacBio Full-Length Transcriptome Sequencing، Isoseq، شناسایی دقیق ایزوفرم های رونوشت را قادر می سازد، پلی آدنیلاسیون و اسپلایسینگ جایگزین را روشن می کند و منجر به تجزیه و تحلیل بیان ژن دقیق تر می شود. خط لوله BMKCloud PacBio Full-Length Transcriptome برای تجزیه و تحلیل کتابخانه های cDNA توالی یابی شده در حالت توالی اجماع دایره ای (CCS) طراحی شده است و توالی های غیرکایمریک (FLNC) تمام طول را شناسایی می کند، که سپس در رونوشت های غیر زائد خوشه بندی می شوند. تجزیه و تحلیل بعدی BUSCO کامل بودن مونتاژ رونوشت را ارزیابی می کند. از رونوشت مونتاژ شده، تجزیه و تحلیل‌های متعددی انجام می‌شود: پیوند جایگزین، تکرار توالی ساده (SSR)، پیش‌بینی lncRNA و ژن‌های هدف مربوطه، پیش‌بینی ژن‌های جدید، تجزیه و تحلیل خانواده ژن، تحلیل عامل رونویسی، و حاشیه‌نویسی عملکردی رونوشت‌ها.