mRNA-Seq (NGS) با ژنوم مرجع
RNA-Seq ابزاری استاندارد در طول زندگی و علوم محصول است و شکاف بین ژنوم و پروتئوم را ایجاد می کند. قدرت آن در کشف نسخه های جدید و تعیین کمیت بیان آنها در یک روش است. این ماده به طور گسترده ای برای مطالعات تطبیقی رونویسی استفاده می شود ، نور را بر روی ژن های مربوط به صفات مختلف یا فنوتیپ ها ، مانند مقایسه جهش ها با انواع وحشی یا آشکار کردن بیان ژن در شرایط خاص ، می ریزد. برنامه bmkcloud mRNA (مرجع) یکپارچه سازی بیان ، تجزیه و تحلیل بیان دیفرانسیل (DEG) و ساختار توالی را در خط لوله بیوانفورماتیک mRNA (NGS) تجزیه و تحلیل می کند و نقاط قوت نرم افزار مشابه را همگام می کند ، از راحتی و دوست داشتن کاربرپسند اطمینان می دهد. کاربران می توانند داده های RNA-SEQ خود را در ابر بارگذاری کنند ، جایی که برنامه یک راه حل جامع و یک مرحله ای تجزیه و تحلیل بیوانفورماتیک ارائه می دهد. علاوه بر این ، این تجربه مشتری را در اولویت قرار می دهد و عملیات شخصی متناسب با نیازهای خاص کاربران را ارائه می دهد. کاربران می توانند پارامترها را تنظیم کرده و مأموریت خط لوله را به خودی خود ارسال کنند ، گزارش تعاملی را بررسی کنند ، داده ها/نمودارها را مشاهده کنند و داده های کاوی کامل را مشاهده کنند ، مانند: انتخاب ژن هدف ، خوشه بندی عملکردی ، نمودار و غیره.
سیستم عامل:Illumina ، MGI
استراتژی:RNA-seq
طرح: متقاضی ، داده های تمیز.
نوع کتابخانه:fr-unstranded ، fr-firstrand یا fr-secondstrand
طول بخوانید:150 BP
نوع پرونده:*.fastq ، *.fq ، *.fastq.gz یا *.fq.gz. سیستم خواهد شدبه طور خودکار پرونده های FASTQ را با توجه به نام پرونده های خود جفت کنید ،به عنوان مثال *_1.FastQ با *._ 2.fastq جفت شد.
تعداد نمونه ها:هیچ محدودیتی در این شماره وجود نداردنمونه ها ، اما زمان تجزیه و تحلیل به عنوان تعداد افزایش می یابدنمونه ها رشد می کنند.
مقدار داده توصیه شده:6 گرم در هر نمونه