ژنوم

مونتاژ در مقیاس کروموزوم و تجزیه و تحلیل ژنوم miscanthus lutarioriparius biomass
توالی نانوپور | Illumina | HI-C | توالی RNA | پیلوژنی
در این مطالعه ، فن آوری های زیستی نشانگر پشتیبانی فنی در توالی نانوپور ، مونتاژ ژنوم de novo ، مونتاژ کمک شده به HI-C و غیره ارائه می دهند.
چکیده
عرفان، یک گیاه چند ساله ریزوماتوز ، از نظر زیست توده بالا و تحمل استرس ، پتانسیل خوبی برای تولید بیولوژیکی دارد. ما یک مونتاژ در مقیاس کروموزوم را گزارش می کنیمmiscanthus lutarioripariusژنوم با ترکیب توالی نانوپور آکسفورد و فن آوری های HI-C. مونتاژ 2.07 گیگابایتی 96.64 ٪ از ژنوم را پوشش می دهد ، با Contig N50 از 1.71 MB. توالی سانترومر و تلومر به ترتیب برای همه 19 کروموزوم و کروموزوم 10 مونتاژ می شود. منشأ آلوتراپلوئید M. lutarioriparius با استفاده از تکرارهای ماهواره ای سانترومری تأیید می شود. ساختار ژنوم تتراپلوئید و چندین تنظیم مجدد کروموزومی نسبت به سورگوم به وضوح نشان داده شده است. ژنهای تکراری پشت سر همM. Lutarioripariusنه تنها در شرایط مربوط به پاسخ به استرس ، بلکه بیوسنتز دیواره سلولی غنی شده است. خانواده های ژن مربوط به مقاومت به بیماری ، بیوسنتز دیواره سلولی و حمل و نقل یون فلزی تا حد زیادی گسترش یافته و تکامل می یابند. گسترش این خانواده ها ممکن است یک مبنای مهم ژنومی برای تقویت صفات قابل توجه ازM. Lutarioriparius.
آمار کلیدی مونتاژ ژنوم


شکل نمای کلی از مونتاژ ژنوم M. lutarioriparius
اخبار و نکات برجسته با هدف به اشتراک گذاشتن جدیدترین موارد موفق با فناوری های زیستی ، به دست آوردن دستاوردهای جدید علمی و همچنین تکنیک های برجسته اعمال شده در طول مطالعه.
زمان پست: ژانویه -05-2022