Exclusive Agency for Korea

条形 بنر -03

خبر

ژنوم

Nature_communications_logo

مونتاژ در مقیاس کروموزوم و تجزیه و تحلیل ژنوم miscanthus lutarioriparius biomass

توالی نانوپور | Illumina | HI-C | توالی RNA | پیلوژنی

در این مطالعه ، فن آوری های زیستی نشانگر پشتیبانی فنی در توالی نانوپور ، مونتاژ ژنوم de novo ، مونتاژ کمک شده به HI-C و غیره ارائه می دهند.

چکیده

عرفان، یک گیاه چند ساله ریزوماتوز ، از نظر زیست توده بالا و تحمل استرس ، پتانسیل خوبی برای تولید بیولوژیکی دارد. ما یک مونتاژ در مقیاس کروموزوم را گزارش می کنیمmiscanthus lutarioripariusژنوم با ترکیب توالی نانوپور آکسفورد و فن آوری های HI-C. مونتاژ 2.07 گیگابایتی 96.64 ٪ از ژنوم را پوشش می دهد ، با Contig N50 از 1.71 MB. توالی سانترومر و تلومر به ترتیب برای همه 19 کروموزوم و کروموزوم 10 مونتاژ می شود. منشأ آلوتراپلوئید M. lutarioriparius با استفاده از تکرارهای ماهواره ای سانترومری تأیید می شود. ساختار ژنوم تتراپلوئید و چندین تنظیم مجدد کروموزومی نسبت به سورگوم به وضوح نشان داده شده است. ژنهای تکراری پشت سر همM. Lutarioripariusنه تنها در شرایط مربوط به پاسخ به استرس ، بلکه بیوسنتز دیواره سلولی غنی شده است. خانواده های ژن مربوط به مقاومت به بیماری ، بیوسنتز دیواره سلولی و حمل و نقل یون فلزی تا حد زیادی گسترش یافته و تکامل می یابند. گسترش این خانواده ها ممکن است یک مبنای مهم ژنومی برای تقویت صفات قابل توجه ازM. Lutarioriparius.

آمار کلیدی مونتاژ ژنوم

اخبار
اخبار -2

شکل نمای کلی از مونتاژ ژنوم M. lutarioriparius

اخبار و نکات برجسته با هدف به اشتراک گذاشتن جدیدترین موارد موفق با فناوری های زیستی ، به دست آوردن دستاوردهای جدید علمی و همچنین تکنیک های برجسته اعمال شده در طول مطالعه.


زمان پست: ژانویه -05-2022

پیام خود را برای ما ارسال کنید: