رونوشت تمام طول نانوپور

توالی رونویسی نانوپور یک روش قدرتمند برای تعیین توالی cDNA های تمام طول ، شناسایی دقیق و کمیت ایزوفرم های متن است. خط لوله رونویسی تمام طول BMKCLOUD برای تجزیه و تحلیل داده های RNA-SEQ تولید شده بر روی پلت فرم نانوپور در برابر یک ژنوم مرجع با کیفیت بالا با کیفیت بالا طراحی شده است و تجزیه و تحلیل کیفی و کمی را در هر دو ژن و رونوشت ارائه می دهد. پس از کنترل کیفیت ، توالی های غیر کیمریک تمام طول (FLNC) به دست می آیند و توالی اجماع برای حذف رونوشت های زائد به ژنوم مرجع نقشه برداری می شوند. از این مجموعه متن ، بیان اندازه گیری می شود و ژنهای متفاوت بیان می شود و رونوشت ها مشخص می شوند و از نظر عملکردی حاشیه نویسی می شوند. خط لوله همچنین شامل تجزیه و تحلیل پلی آدنیلاسیون جایگزین (APA) ، تجزیه و تحلیل ترکیبی جایگزین ، تجزیه و تحلیل توالی ساده (SSR) ، پیش بینی lncRNA و اهداف مربوطه ، پیش بینی توالی های کد نویسی (CDS) ، تجزیه و تحلیل خانواده ژن ، تجزیه و تحلیل عاملی رونویسی ، پیش بینی ژنهای جدید و حاشیه نویسی عملکردی رونوشت ها.