mRNA-seq (NGS) - De Novo
توالی یابی mRNA اجازه می دهد تا پروفایل تمام رونوشت های mRNA در سلول ها تحت شرایط خاص مشخص شود و یک فناوری پرکاربرد در زمینه های مختلف تحقیقاتی است. خط لوله mRNA-seq BMKCloud De novo برای تجزیه و تحلیل کتابخانه های توالی یابی غنی شده با poly-A در زمانی که ژنوم مرجع در دسترس نیست طراحی شده است. خط لوله با کنترل کیفیت شروع می شود و به دنبال آناز نومونتاژ رونوشت و انتخاب مجموعه یونیژن تجزیه و تحلیل ساختار unigene توالی کدگذاری (CDS) و تکرارهای توالی ساده (SSR) را پیش بینی می کند. متعاقبا، تجزیه و تحلیل بیان دیفرانسیل، ژن‌های بیان شده متفاوت (DEGs) را در میان شرایط آزمایش شده، به دنبال حاشیه‌نویسی عملکردی و غنی‌سازی DEGs برای استخراج بینش‌های بیولوژیکی پیدا می‌کند.
بیوانفورماتیک
