Metagenomics (NGS)

متاژنومیک اسلحه با Illumina ابزاری محبوب برای مطالعه میکروبیوم ها با توالی مستقیم DNA از نمونه های پیچیده است و امکان مطالعه هر دو تنوع تاکسونومیکی و عملکردی را فراهم می کند. خط لوله BMKCloud Metagenomic (NGS) با کنترل کیفیت و مونتاژ متاگنوم آغاز می شود ، که از آن ژن ها پیش بینی می شوند و به مجموعه داده های غیر مجانی که برای عملکرد و طبقه بندی با استفاده از پایگاه داده های متعدد حاشیه نویسی می شوند. این اطلاعات برای تجزیه و تحلیل تنوع طبقه بندی درون نمونه (تنوع آلفا) و تنوع بین نمونه (تنوع بتا) استفاده می شود. تجزیه و تحلیل دیفرانسیل بین گروهها عملکردهای OTU و بیولوژیکی را پیدا می کند که بین دو گروه با استفاده از هر دو آزمایش پارامتری و غیر پارامتری متفاوت است ، در حالی که تجزیه و تحلیل همبستگی این تفاوت ها را با عوامل محیطی مرتبط می کند.