
lncRNA
RNA های طولانی غیر کد کننده (lncRNA) RNA هایی طولانی تر از 200 نوکلئوتید با پتانسیل کدگذاری کم اما با عملکردهای تنظیمی حیاتی هستند. خط لوله BMKCloud lncRNA برای تجزیه و تحلیل کتابخانههای تهیشده rRNA با ژنوم مرجع با کیفیت بالا، با تجزیه و تحلیل بیان lncRNA و mRNA با هم طراحی شده است. پس از برش خواندن و کنترل کیفیت، قرائتها برای جمعآوری رونوشتها با ژنوم مرجع تراز میشوند و تجزیه و تحلیل ساختار ژن بعدی، پیوند جایگزین و ژنهای جدید را نشان میدهد. رونوشت ها به عنوان mRNA ها یا lncRNA ها شناسایی می شوند و تجزیه و تحلیل بیان تفاضلی lncRNA های بیان شده متفاوت، اهداف آنها و ژن های بیان شده متفاوت (DEGS) را شناسایی می کند. هم DEGها و هم اهداف lncRNA با بیان متفاوت از نظر عملکردی برای یافتن دستههای عملکردی غنیشده حاشیهنویسی میشوند.
بیوانفورماتیک
