Exclusive Agency for Korea

条形 بنر -03

محصولات

تعامل کروماتین مبتنی بر HI-C

HI-C روشی است که برای ضبط پیکربندی ژنومی با ترکیب تعامل مبتنی بر نزدیکی و توالی با توان بالا طراحی شده است. این روش مبتنی بر اتصال کروماتین با فرمالدئید است ، و پس از آن هضم و قفل مجدد به گونه ای است که فقط قطعاتی که به صورت کووالانسی در ارتباط هستند ، محصولات بستن را تشکیل می دهند. با تعیین توالی این محصولات بستن ، می توان سازمان سه بعدی ژنوم را مطالعه کرد. HI-C مطالعه توزیع بخش هایی از ژنوم را که به آرامی بسته بندی شده اند (محفظه ای ، ایچروماتین) و به احتمال زیاد فعال تر رونویسی و مناطقی که محکم تر بسته بندی شده اند ، امکان پذیر می کند. HI-C همچنین می تواند برای مشخص کردن دامنه های توپولوژیکی (TAD) ، مناطقی از ژنوم که ساختارهای تاشو دارند و احتمالاً الگوهای بیان مشابهی دارند ، استفاده شود و برای شناسایی حلقه های کروماتین ، مناطق DNA که توسط پروتئین ها لنگر می زنند و این موارد هستند غالباً در عناصر نظارتی غنی می شوند. سرویس توالی HI-C BMKGENE محققان را قادر می سازد تا ابعاد مکانی ژنومیک را کشف کنند و راه های جدیدی را برای درک تنظیم ژنوم و پیامدهای آن در سلامت و بیماری باز کنند.


جزئیات خدمات

بیوانفورماتیک

نتایج نسخه ی نمایشی

انتشارات برجسته

ویژگی های خدمات

● توالی در Illumina novaseq با PE150.

service سرویس به جای اسیدهای نوکلئیک استخراج شده ، به نمونه های بافت نیاز دارد تا با فرمالدئید پیوند متقابل و حفظ فعل و انفعالات DNA پروتئین داشته باشد.

● آزمایش HI-C شامل محدودیت و ترمیم انتهای انتهای چسبنده با بیوتین است ، و به دنبال آن دایره ای از انتهای مبهم حاصل ضمن حفظ تعامل. سپس DNA با مهره های استرپتاویدین به پایین کشیده می شود و برای تهیه کتابخانه بعدی خالص می شود.

مزایای خدمات

طراحی آنزیم محدودیت بهینه: برای اطمینان از راندمان HI-C بالا در گونه های مختلف با حداکثر 93 ٪ جفت تعامل معتبر.

تخصص گسترده و سوابق انتشار:BMKGENE تجربه گسترده ای با> 2000 پروژه توالی HI-C از 800 گونه مختلف و ثبت اختراعات مختلف دارد. بیش از 100 مورد منتشر شده با ضریب تأثیر تجمع بیش از 900.

تیم بیوانفورماتیک بسیار ماهر:با ثبت اختراعات داخلی و کپی رایت نرم افزار برای آزمایش های HI-C و تجزیه و تحلیل داده ها و یک نرم افزار داده تجسم خود توسعه یافته.

پشتیبانی پس از فروش:تعهد ما فراتر از اتمام پروژه با یک دوره خدمات 3 ماهه پس از فروش است. در این مدت ، ما پیگیری پروژه ، کمک عیب یابی و جلسات پرسش و پاسخ را برای رسیدگی به هرگونه سؤالات مربوط به نتایج ارائه می دهیم.

حاشیه نویسی جامع: ما از چندین بانک اطلاعاتی برای حاشیه نویسی عملکردی ژن ها با تغییرات مشخص شده و تجزیه و تحلیل غنی سازی مربوطه استفاده می کنیم و بینش هایی در مورد چندین پروژه تحقیقاتی ارائه می دهیم.

مشخصات خدماتی

کتابخانه

استراتژی توالی

خروجی داده های توصیه شده

وضوح سیگنال HI-C

کتابخانه HI-C

Illumina PE150

حلقه کروماتین: 150 برابر

TAD: 50x

حلقه کروماتین: 10 کیلوبایت

TAD: 40 کیلوبایت

نیازهای خدمات

نوع نمونه

مقدار مورد نیاز

بافت حیوانی

≥2 گرم

خون

2 میلی لیتر

قارچ

1 گرم

گیاه- بافت جوان

1G/Aliquot ، 2-4 Aliquotes توصیه می شود

سلولهای کشت شده

≥1x107


  • قبلی:
  • بعدی:

  • 98 پوند

    شامل تجزیه و تحلیل زیر است:

    ● داده خام QC ؛

    ● نقشه برداری و کتابخانه HI-C QC: جفت تعامل معتبر و نمایندگان پوسیدگی تعامل (IDE) ؛

    proffection پروفایل تعامل گسترده ژنوم: تجزیه و تحلیل CIS/ترانس و نقشه تعامل HI-C ؛

    ● تجزیه و تحلیل توزیع محفظه A/B ؛

    ● شناسایی TAD ها و حلقه های کروماتین ؛

    analysis تجزیه و تحلیل دیفرانسیل بر روی عناصر ساختار کروماتین سه بعدی در بین نمونه ها و حاشیه نویسی عملکردی مربوط به ژنهای مرتبط.

    CIS و توزیع نسبت ترانس

    99 图片

     

    نقشه حرارتی تعامل کروموزومی بین نمونه ها

    100 پوند

     

    توزیع گسترده ای از محفظه های A/B23 图片

     

    توزیع گسترده ژنوم حلقه های کروماتین

     

    102 پوند

     

    تجسم TADS

    103 پوند

     

    پیشرفت های پژوهشی را که توسط خدمات توالی HI-C BMKGENE از طریق مجموعه ای از انتشارات تسهیل شده است ، کاوش کنید.

     

     

    منگ ، T. و همکاران. (2021) "یک تجزیه و تحلیل مقایسه ای چندمیک یکپارچه CA2 را به عنوان یک هدف جدید برای وتر مشخص می کند" ،علم عصب شناسی عصبی، 23 (10) ، صص 1709-1722. doi: 10.1093/neuonc/noab156.

    Xu ، L. و همکاران. (2021) "سازماندهی سه بعدی و تنظیم مجدد ژنوم بینش در مورد پاتوژنز NAFLD توسط یکپارچه HI-C ، نانوپور و توالی RNA" ،Acta Pharmaceutica sinica b، 11 (10) ، صص 3150-3164. doi: 10.1016/j.apsb.2021.03.022.

    نقل قول کنید

    پیام خود را اینجا بنویسید و آن را برای ما ارسال کنید

    پیام خود را برای ما ارسال کنید: