Exclusive Agency for Korea

条形 بنر -03

محصولات

مونتاژ ژنوم قارچی de novo

53 پوند

 

 

BMKGENE راه حل های همه کاره برای ژنوم قارچی ، پذیرایی از نیازهای تحقیقاتی متنوع و کامل بودن ژنوم مورد نظر ارائه می دهد. استفاده از توالی Illumina به تنهایی به تنهایی امکان تولید ژنوم پیش نویس را فراهم می کند. خواندن کوتاه و توالی طولانی با استفاده از نانوپور یا PACBIO برای یک ژنوم قارچی تصفیه شده تر با ترکیبات طولانی تر ترکیب می شوند. علاوه بر این ، ادغام توالی HI-C باعث افزایش بیشتر قابلیت ها می شود و امکان دستیابی به یک ژنوم کامل در سطح کروموزوم را فراهم می کند.


جزئیات خدمات

بیوانفورماتیک

نتایج نسخه ی نمایشی

انتشارات برجسته

ویژگی های خدمات

با سه گزینه ممکن برای انتخاب بسته به درجه مورد نظر کامل بودن ژنوم:

گزینه ژنوم پیش نویس: توالی کوتاه خواندن با Illumina Novaseq PE150.

گزینه ژنوم خوب قارچی:

بررسی ژنوم: Illumina Novaseq PE150.

مونتاژ ژنوم: Pacbio Revio (HIFI می خواند) یا Promethion 48 نانوپور.

ژنوم قارچی سطح کروموزوم:

بررسی ژنوم: Illumina Novaseq PE150.

مونتاژ ژنوم: Pacbio Revio (HIFI می خواند) یا Promethion 48 نانوپور.

لنگر انداختن با مونتاژ HI-C.

مزایای خدمات

استراتژی توالی چندگانه موجود است: برای اهداف مختلف تحقیق و الزامات کامل بودن ژنوم

گردش کار کامل بیوانفورماتیک:این شامل مونتاژ ژنوم و پیش بینی عناصر ژنومی متعدد ، حاشیه نویسی ژن عملکردی و لنگر انداختن Contig است.

تخصص گسترده: با مونتاژ بیش از 12000 ژنوم میکروبی ، ما بیش از یک دهه تجربه ، یک تیم تجزیه و تحلیل بسیار ماهر ، محتوای جامع و پشتیبانی عالی پس از فروش را به ارمغان می آوریم.

پشتیبانی پس از فروش:تعهد ما فراتر از اتمام پروژه با یک دوره خدمات 3 ماهه پس از فروش است. در این مدت ، ما پیگیری پروژه ، کمک عیب یابی و جلسات پرسش و پاسخ را برای رسیدگی به هرگونه سؤالات مربوط به نتایج ارائه می دهیم.

مشخصات خدماتی

خدمت

استراتژی توالی

کنترل کیفیت

پیش نویس ژنوم

Illumina PE150 100x

q30≥85 ٪

ژنوم خوب

بررسی ژنوم: Illumina PE150 50 x

مونتاژ: PACBIO HIFI 30X یا NANOPORE 100X

contig n50 ≥1mb (pacbio unicellular

contig n50 ≥2mb (ont unicellular

Contig N50 ≥500kb (دیگران

ژنوم در سطح کروموزوم

بررسی ژنوم: Illumina PE150 50 x

مونتاژ: PACBIO HIFI 30X یا NANOPORE 100X

مونتاژ HI-C 100 برابر

نسبت لنگرگاه Contig> 90 ٪

 

نیازهای خدمات

 

غلظت (ng/μl)

مقدار کل (میکروگرم)

حجم (میکرولیتر)

OD260/280

OD260/230

پستان

≥ 20

≥ 2

≥ 20

1.7-2.2

≥1.6

نانوپور

≥ 40

≥ 2

≥ 20

1.7-2.2

1.0-3.0

ایلومینا

≥1

.0.06

≥ 20

-

-

قارچ تک سلولی: ≥3.5x1010 سلولها

قارچ ماکرو: 10 گرم

 

جریان کار خدمات

تحویل نمونه

تحویل نمونه

تهیه کتابخانه

ساخت کتابخانه

توالی

توالی

تجزیه و تحلیل

تجزیه و تحلیل

خدمات پس از فروش

خدمات پس از فروش


  • قبلی:
  • بعدی:

  • 未标题 -1-01

    شامل تجزیه و تحلیل زیر است:

    بررسی ژنوم:

    • توالی کنترل کیفیت داده ها
    • تخمین ژنوم: اندازه ، هتروزیگوسیته ، عناصر تکراری

    مونتاژ ژنوم خوب:

    • توالی کنترل کیفیت داده ها
    • دن نوومجمع
    • تجزیه و تحلیل مؤلفه ژنوم: پیش بینی CDS و عناصر ژنومی متعدد
    • حاشیه نویسی عملکردی با چندین پایگاه داده عمومی (GO ، KEGG و غیره) و بانکهای اطلاعاتی پیشرفته (کارت ، VFDB و غیره)

    HI-C مونتاژ:

    • ارزیابی کتابخانه HI-C.
    • لنگر انداختن خوشه بندی ، سفارش و جهت گیری
    • ارزیابی مونتاژ HI-C: بر اساس ژنوم مرجع و نقشه گرما

    بررسی ژنوم: توزیع K-Mer

     

     54 图片

    مونتاژ ژنوم: حاشیه نویسی همولوگ ژن (پایگاه داده NR)

     

     55 图片

     

    مونتاژ ژنوم: حاشیه نویسی ژن عملکردی (GO)

     

    56 پوند

    پیشرفت های تسهیل شده توسط خدمات مونتاژ ژنوم قارچی BMKGENE را از طریق مجموعه ای از انتشارات ، کشف کنید.

     

    هائو ، جی. و همکاران. (2023) "پروفایل یکپارچه OMIC از قارچ دارویی inonotus obliquus در شرایط غوطه ور ،"ژنومیک BMC، 24 (1) ، صص 1-12. doi: 10.1186/s12864-023-09656-z/شکل/3.

    لو ، ل. و همکاران. (2023) "توالی ژنوم تکامل و مکانیسم های بیماری زا از پاتوژن شدید گندم Rhizoctonia serealis را نشان می دهد ،مجله محصول، 11 (2) ، صص 405-416. doi: 10.1016/j.cj.2022.07.024.

    ژانگ ، H. و همکاران. (2023) "منابع ژنوم برای چهار گونه Clarireedia که باعث ایجاد دلار در چمن های مختلف می شود" ،بیماری گیاهی، 107 (3) ، صص 929-934. doi: 10.1094/PDIS-08-22-1921-A

    ژانگ ، SS و همکاران. (2023) "شواهد ژنتیکی و مولکولی یک سیستم جفت گیری تتراپولار در قارچ خوراکی Grifola Frondosa" ،مجله قارچ، 9 (10) ، ص. 959. doi: 10.3390/jof9100959/s1.

    نقل قول کنید

    پیام خود را اینجا بنویسید و آن را برای ما ارسال کنید

    پیام خود را برای ما ارسال کنید: