ژنتیک تکاملی
مزایای خدمات
تاکاگی و همکاران ،مجله گیاه، 2013
●تجزیه و تحلیل جامع بیوانفورماتیک:فعال کردن تخمین تنوع ژنتیکی ، که نشان دهنده پتانسیل تکاملی گونه ها است ، و آشکار کردن رابطه فیلوژنتیک قابل اعتماد بین گونه ها با تأثیر به حداقل رساندن تکامل همگرا و تکامل موازی
●تجزیه و تحلیل سفارشی اختیاری: مانند تخمین زمان واگرایی و سرعت بر اساس تغییرات در سطح نوکلئوتید و آمینه.
●سوابق گسترده تخصص و انتشار: BMKGENE بیش از 15 سال تجربه گسترده ای را در پروژه های ژنتیک جمعیت و تکاملی جمع کرده است ، و هزاران گونه و غیره را پوشش می دهد و به بیش از 1000 پروژه سطح بالا که در ارتباطات طبیعت ، گیاهان مولکولی ، مجله بیوتکنولوژی گیاهی و غیره منتشر شده است ، کمک کرده است.
team تیم بیوانفورماتیک بسیار ماهر و چرخه تجزیه و تحلیل کوتاه: با تجربه عالی در تجزیه و تحلیل ژنومیک پیشرفته ، تیم BMKGENE با یک زمان چرخش سریع ، تجزیه و تحلیل های جامع را ارائه می دهد.
post پشتیبانی پس از فروش:تعهد ما فراتر از اتمام پروژه با یک دوره خدمات 3 ماهه پس از فروش است. در این مدت ، ما پیگیری پروژه ، کمک عیب یابی و جلسات پرسش و پاسخ را برای رسیدگی به هرگونه سؤالات مربوط به نتایج ارائه می دهیم.
مشخصات و الزامات خدمات
| نوع توالی | مقیاس جمعیت توصیه شده | استراتژی توالی | الزامات نوکلئوتیدی |
| توالی ژنوم کامل | 30 ≥ فرد ، با 10 پوند از هر زیر گروه
| 10x | غلظت: 1 ng/ میکرولیتر مقدار کل 30Ng محدود یا بدون تخریب یا آلودگی |
| قطعه تقویت شده با تمرکز خاص (SLAF) | عمق برچسب: 10x تعداد برچسب ها: <400 مگابایت: WGS توصیه می شود <1 گیگابایت: برچسب های 100k 1 گیگابایت > برچسب های 2 گیگابایتی: 300k برچسب های حداکثر 500k | غلظت 5 نانوگرم در میکرولیتر مقدار کل 80 نانوگرم Nanodrop OD260/280 = 1.6-2.5 ژل آگارز: تخریب یا آلودگی محدود یا محدود
|
جریان کار خدمات
طرح آزمایش
تحویل نمونه
ساخت کتابخانه
توالی
تجزیه و تحلیل
خدمات پس از فروش
خدمات شامل تجزیه و تحلیل ساختار جمعیت (درخت فیلوژنتیک ، PCA ، نمودار طبقه بندی جمعیت) ، تنوع جمعیت و انتخاب جمعیت (عدم تعادل پیوند ، انتخاب انتخابی رفت و برگشت از سایت های سودمند) است. این سرویس همچنین می تواند شامل تجزیه و تحلیل سفارشی (به عنوان مثال زمان واگرایی ، جریان ژن) باشد.
*نتایج نسخه ی نمایشی نشان داده شده در اینجا همه از ژنوم منتشر شده با BMKGENE است
1. تجزیه و تحلیل Evolution حاوی ساخت درخت فیلوژنتیک ، ساختار جمعیت و PCA بر اساس تغییرات ژنتیکی است.
درخت فیلوژنتیک نمایانگر روابط طبقه بندی و تکاملی در بین گونه هایی با جد مشترک است.
PCA هدف از تجسم نزدیکی بین جمعیت زیر است.
ساختار جمعیت وجود زیر جمعیت از نظر ژنتیکی از نظر فرکانس آلل را نشان می دهد.
چن ، و هم آل. ،PNA، 2020
2. جارو انتخابی
رفت و برگشت انتخابی به فرایندی اشاره دارد که با استفاده از آن یک سایت سودمند انتخاب می شود و فرکانس های سایت های خنثی مرتبط افزایش می یابد و سایت های بدون اتصال کاهش می یابد و در نتیجه کاهش منطقه ای.
تشخیص گسترده ژنوم در مناطق رفت و برگشت انتخابی با محاسبه شاخص ژنتیکی جمعیت （π ， FST ، D تاجیما) از تمام SNP ها در یک پنجره کشویی (100 کیلوبایت) در مرحله خاص (10 کیلوبایت) پردازش می شود.
تنوع نوکلئوتیدی (π）
تاجیما د
شاخص تثبیت (FST)
وو ، و هم آل. ،گیاه مولکولی، 2018
3. جریان ژن
وو ، و هم آل. ،گیاه مولکولی، 2018
4. تاریخ جمعیتی
ژانگ ، و دیگران. آل. ،محیط زیست طبیعت و تکامل، 2021
5. زمان دگرگونی
ژانگ ، و دیگران. آل. ،محیط زیست طبیعت و تکامل، 2021
پیشرفت های تسهیل شده توسط خدمات ژنتیک تکاملی BMKGENE را از طریق مجموعه ای از نشریات مورد نظر کشف کنید:
Hassanyar ، Ak et al. (2023) "کشف نشانگرهای مولکولی SNP و ژنهای کاندیدای مرتبط با مقاومت ویروس ساکبرود در لاروهای Apis cerana cerana توسط رزولوشن ژنوم ،"مجله بین المللی علوم مولکولی، 24 (7). doi: 10.3390/ijms24076238.
چای ، جی. و همکاران. (2022) "کشف یک غول غول پیکر و ژنتیکی خالص چینی Salamander فرصت های جدید حفاظت را ایجاد می کند" ،تحقیقات جانورشناسی، 2022 ، جلد. 43 ، شماره 3 ، صفحات: 469-480 ، 43 (3) ، صص 469-480. doi: 10.24272/j.issn.2095-8137.2022.101.
هان ، م. و همکاران. (2022) "الگوی فیلوژوگرافی و تاریخ تکامل جمعیت الییموس سیبیریکوس بومی در فلات Qinghai-Tibetan" ،مرزهای علوم گیاه، 13 ، ص. 882601. doi: 10.3389/fpls.2022.882601/bibtex.
وانگ ، جی. و همکاران. (2022) "بینش ژنومی در مورد تکامل لانگان از یک مونتاژ ژنوم در سطح کروموزوم و ژنومیک جمعیتی از الحاق Longan" ،تحقیقات باغبانی، 9. doi: 10.1093/hr/uhac021.
