توالی mRNA یوکاریوتی-NGS
ویژگی ها
● گرفتن پلی mRNA قبل از آماده سازی کتابخانه
● آماده سازی کتابخانه mRNA جهت دار اختیاری برای فعال کردن داده های توالی یابی رشته خاص
● تجزیه و تحلیل بیوانفورماتیک بیان ژن و ساختار رونوشت
مزایا
●تخصص گسترده: تیم ما بیش از 600000 نمونه را در BMKgene پردازش کرده است که شامل انواع مختلف نمونه مانند کشت سلول، بافت و مایعات بدن است. ما تجربه زیادی را برای هر پروژه به ارمغان می آوریم و بیش از 100000 پروژه mRNA-Seq را در حوزه های مختلف تحقیقاتی با موفقیت به پایان رسانده ایم.
●کنترل کیفیت دقیق: ما نقاط کنترل اصلی را در تمام مراحل، از آماده سازی نمونه و کتابخانه گرفته تا توالی یابی و بیوانفورماتیک، پیاده سازی می کنیم. این نظارت دقیق، ارائه نتایج مداوم با کیفیت بالا را تضمین می کند و به شما اطمینان می دهد که پروژه شما در دستان قابل اعتماد است.
●حاشیه نویسی جامع: ما از چندین پایگاه داده برای حاشیه نویسی عملکردی ژن های بیان شده متفاوت (DEGs) و انجام تحلیل های غنی سازی مربوطه استفاده می کنیم. این رویکرد جامع بینش هایی را در مورد فرآیندهای سلولی و مولکولی زیربنایی پاسخ رونوشت ارائه می دهد و اطمینان می دهد که شما به طور کامل از نتایج پروژه خود مطلع هستید.
●پشتیبانی پس از فروش: تعهد ما فراتر از اتمام پروژه با یک دوره خدمات پس از فروش 3 ماهه است. در طول این مدت، ما پیگیری پروژه، کمک عیب‌یابی، و جلسات پرسش و پاسخ را برای پاسخگویی به هرگونه سؤال مرتبط با نتایج ارائه می‌دهیم.
نمونه مورد نیاز و تحویل
| کتابخانه | استراتژی توالی | داده ها توصیه می شود | کنترل کیفیت |
| پلی A غنی شده است | ایلومینا PE150 DNBSEQ-T7 | 6-10 گیگابایت | Q30≥85% |
نمونه مورد نیاز:
نوکلئوتیدها:
| Conc.(ng/μl) | مقدار (μg) | خلوص | صداقت | |
| کتابخانه استاندارد | ≥ 10 | ≥ 0.2 | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 آلودگی پروتئین یا DNA محدود یا بدون آلودگی روی ژل نشان داده شده است. | برای گیاهان: RIN≥4.0; برای حیوانات: RIN≥4.5؛ 5.0≥28S/18S≥1.0; ارتفاع پایه محدود یا بدون ارتفاع |
| کتابخانه جهت دار | ≥ 10 | ≥ 0.2 | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 آلودگی پروتئین یا DNA محدود یا بدون آلودگی روی ژل نشان داده شده است. | برای گیاهان: RIN≥4.0; برای حیوانات: RIN≥4.5؛ 5.0≥28S/18S≥1.0; ارتفاع پایه محدود یا بدون ارتفاع |
● گیاهان:
ریشه، ساقه یا گلبرگ: 450 میلی گرم
برگ یا دانه: 300 میلی گرم
میوه: 1.2 گرم
●حیوان:
قلب یا روده: 300 میلی گرم
احشاء یا مغز: 240 میلی گرم
عضله: 450 میلی گرم
استخوان، مو یا پوست: 1 گرم
● بندپایان:
حشرات: 6 گرم
سخت پوستان: 300 میلی گرم
● خون کامل: 1 لوله
● سلول ها: 106 سلول ها
تحویل نمونه توصیه شده
ظرف: لوله سانتریفیوژ 2 میلی لیتری (فیل قلع توصیه نمی شود)
برچسب زدن نمونه: گروه + تکرار به عنوان مثال A1، A2، A3. B1، B2، B3...
حمل و نقل:
1. یخ خشک: نمونه ها باید در کیسه های بسته بندی شده و در یخ خشک دفن شوند.
2. لوله های جدول RNA: نمونه های RNA را می توان در لوله تثبیت کننده RNA (به عنوان مثال RNAstable®) خشک کرد و در دمای اتاق حمل کرد.
جریان کار خدمات
طراحی آزمایش
تحویل نمونه
استخراج RNA
ساخت کتابخانه
توالی یابی
تجزیه و تحلیل داده ها
خدمات پس از فروش
بیوانفورماتیک
یوکاریوتی گردش کار تجزیه و تحلیل توالی mRNA
بیوانفورماتیک
Øکنترل کیفیت داده های خام
Øهمترازی ژنوم مرجع
Øتحلیل ساختار رونوشت
Øکمی سازی بیان
Øتجزیه و تحلیل بیان دیفرانسیل
Øحاشیه نویسی و غنی سازی عملکرد
تراز ژنوم مرجع
اشباع داده ها
همبستگی نمونه و ارزیابی تکرارهای بیولوژیکی
ژن های بیان شده متفاوت (DEG)
حاشیه نویسی عملکردی DEGs
غنی سازی عملکردی DEG ها
پیشرفت‌های تسهیل‌شده توسط سرویس‌های توالی‌یابی mRNA یوکاریوتی NGS BMKGene را از طریق مجموعه‌ای منتخب از انتشارات کاوش کنید.
هوانگ، ال و همکاران (2023) "تریکلوزان و تری کلوکاربان ظرفیت بویایی ماهی قرمز را با محدود کردن تشخیص بو، مختل کردن انتقال سیگنال بویایی و اختلال در پردازش اطلاعات بویایی تضعیف می کنند"، تحقیقات آب، 233، ص. 119736. doi: 10.1016/J.WATRES.2023.119736.
جیا، LJ و همکاران. (2023) 'Aspergillus fumigatus p11 انسانی را می رباید تا فاگوزوم های حاوی قارچ را به مسیر غیر تخریبی هدایت کند'، Cell Host & Microbe, 31(3)، صفحات 373-388.e10. doi: 10.1016/J.CHOM.2023.02.002.
جین، ک. و همکاران. (2022) "عوامل رونویسی TCP دخیل در رشد شاخساره ما بامبو (Dendrocalamus latiflorus Munro)"، مرزها در علوم گیاهی، 13، ص. 884443. doi: 10.3389/FPLS.2022.884443/BIBTEX.
ون، ایکس و همکاران. (2022) "ژنوم گل داودی lavandulifolium و مکانیسم مولکولی زیربنایی انواع کاپیتولوم"، تحقیقات باغبانی، 9. doi: 10.1093/HR/UHAB022.
ژانگ، یوجی و همکاران. (2023) "نانوراکتور آبشاری برای تقویت درمان سونودینامیک در سرطان کولورکتال از طریق تقویت ROS هم افزایی و انسداد اتوفاژی"، نانو امروز، 49، ص. 101798. doi: 10.1016/J.NANTOD.2023.101798.
