توالی DNA/RNA - ترتیب سنج نانوپور
ویژگی های جزئیات خدمات
| پلتفرم | اندازه کتابخانه | عملکرد داده های نظری (در هر سلول) | دقت تک پایه | برنامه |
| نانوپور | 8KB ، 10KB ، 20KB ، Ultralong ، cDNA-PCR | 70-90 گیگابایت/سلول | 85-92 ٪ | SV فراخوانی ، de novo ، توالی تمام طول ، ISO-SEQ ، حاشیه نویسی ژن ، تشخیص متیلاسیون DNA |
مزایای خدمات
● تجربه بیش از 5 سال در سکوی توالی PACBIO با هزاران پروژه بسته با گونه های مختلف.
● BMKGENE یک شریک رسمی آکسفورد نانوپور است که دارای گواهینامه RNA/DNA دوگانه است.
models مدلهای اصلی ترتیب سنج ها با تجهیزات کامل و توان توالی کافی وجود دارد.
● بر اساس پلت فرم نانوپور ، بیش از 10 تحقیق از حیوانات و گیاهان Denovo در مجلات مشهور بین المللی منتشر شده است.
نمونه مورد نیاز
| نوع نمونه | مقدار | تمرکز (Quit ®) | حجم | خلوص | دیگران |
| DNA ژنومی | بستگی به نیاز داده ها دارد | ≥20ng/میکرولیتر | ≥15μl | OD260/280 = 1.7-2.2 ؛ OD260/230≥1.5 قله پاک در 260 نانومتر ， بدون آلودگی | غلظت باید توسط quit و quit/quit/nanopore ≤ 2 اندازه گیری شود |
| کل RNA | 1.2 میکروگرم | ≥100μg/میکرولیتر | ≥15μl | OD260/280 = 1.7-2.5 ؛ OD260/230 = 0.5-2.5 ； بدون آلودگی | مقدار RIN 7.5 |
گردش کار
تهیه نمونه
ساخت کتابخانه
توالی
تجزیه و تحلیل
تحویل پروژه
ارزیابی کیفیت داده از نمونه DNA
جدول 1. آمار در مورد داده های پاک.
| BMKID | رفیق | خاردار | Cleanseqnum | پاک کننده | cleann50len | Cleann90len | پاکسازی | پاک کننده | تمیز |
| DNA_BMK01 | 1،218،239 | 26.37 | 1،121،736 | 25.90 | 28،014 | 15،764 | 23،090 | 143،181 | 9 |
ارزیابی کیفیت داده از نمونه RNA
جدول 1. آمار در مورد داده های پاک.
| نام پرونده | مشتری | یدک | پایه | N50 | طول | حداکثر | میانگین |
| RNA_BMK001 | C2 | 8،947،708 | 4،047،230،083 | 398 | 452 | 129،227 | q12 |
شکل 1 توزیع طول را بخوانید
شکل 2. توزیع نمره کیفیت داده های پاک
شکل 3. توزیع طول و کیفیت داده های تمیز
