●سیستم عامل ها:Illumina Novaseq 6000 و Novaseq X Plus
●حالت های توالی:PE150 و PE250
●کنترل کیفیت کتابخانه ها قبل از توالی
●توالی داده QC و تحویل:تحویل گزارش QC و داده های خام در قالب FASTQ پس از demultiplexing و فیلتر Q30 می خواند
●تطبیق پذیری خدمات توالی:مشتری ممکن است دنباله ای را به صورت خط ، سلول جریان یا میزان داده مورد نیاز (توالی جزئی خط) انتخاب کند.
●تجربه گسترده در سیستم عامل توالی Illumina:با هزاران پروژه بسته با گونه های مختلف.
●تحویل گزارش QC توالی:با معیارهای با کیفیت ، دقت داده ها و عملکرد کلی پروژه توالی.
●فرآیند توالی بالغ:با زمان کوتاه چرخش.
●کنترل کیفیت دقیق: ما الزامات دقیق QC را برای تضمین تحویل نتایج با کیفیت بالا اجرا می کنیم.
پلتفرم | سلول جریان | حالت توالی | واحد | خروجی تخمین زده شده |
novaseq x | 10b (8 خط) | PE150 | یک خط خط جزئی | 375 گیگابایت / خط |
25b (8 خط) | PE150 | یک خط خط جزئی | 1000 گیگابایت در خط | |
Novaseq 6000 | سلول جریان SP (2 خط) | PE250 | سلول جریان یک خط خط جزئی | 325-400 متر خواندن / خط |
سلول جریان S4 (4 خط) | PE150 | سلول جریان یک خط خط جزئی | 800 گیگابایت / خط |
مقدار داده (x) | غلظت (qPCR/NM) | حجم | |
توالی خط جزئی
| x ≤ 10 گیگابایت | ≥ 1 نانومتر | 25 میکرولیتر |
10 گیگابایت <x ≤ 50 گیگابایت | ≥ 2 نانومتر | 25 میکرولیتر | |
50 گیگابایت <x ≤ 100 گیگابایت | 3 نانومتر | 25 میکرولیتر | |
x> 100 گیگابایت | 4 نانومتر | 25 میکرولیتر | |
توالی خط | هر خط | استخر 1.5 نانومتر / کتابخانه | 25 میکرولیتر / استخر کتابخانه |
علاوه بر غلظت و مقدار کل ، یک الگوی اوج مناسب نیز لازم است.
توجه: توالی خط کتابخانه های کم تنوع برای اطمینان از فراخوانی پایه قوی ، به فیکس سنبله نیاز دارد.
توصیه می کنیم کتابخانه های قبل از تهیه را به عنوان نمونه ارسال کنید. اگر برای انجام جمع آوری کتابخانه به BMKGENE نیاز دارید ، لطفاً به آنها مراجعه کنید
الزامات کتابخانه برای توالی خط جزئی.
قله اصلی باید در 300-450 جفت باز باشد.
کتابخانه ها باید یک قله اصلی واحد ، بدون آلودگی آداپتور و دیمر آغازگر داشته باشند.
گزارشی از کیفیت کتابخانه قبل از توالی ، ارزیابی میزان کتابخانه و تکه تکه شدن ارائه شده است.
جدول 1. آمار در مورد داده های توالی.
شناسه نمونه | BMKID | خواندن خام | داده های خام (BP) | خواندن تمیز (٪) | Q20 (٪) | Q30 (٪) | GC (٪) |
C_01 | BMK_01 | 22،870،120 | 6،861،036،000 | 96.48 | 99.14 | 94.85 | 36.67 |
C_02 | BMK_02 | 14،717،867 | 4،415،360،100 | 96.00 | 98.95 | 93.89 | 37.08 |
شکل 1. توزیع کیفیت در طول خوانده شده در هر نمونه
شکل 2 توزیع محتوای پایه
شکل 3 توزیع محتوای خواندن در داده های توالی