CircRNA

RNA های حلقوی (circRNAs) RNA های غیر کد کننده ای هستند که ساختارهای دایره ای را تشکیل می دهند و نقش های تنظیمی متعددی دارند، از جمله رقابت با miRNA برای ژن های هدف و اتصال پروتئین. خط لوله BMKCloud circRNA برای تجزیه و تحلیل کتابخانه های تهی شده rRNA با یک ژنوم مرجع با حاشیه نویسی خوب و با کیفیت بالا طراحی شده است. تجزیه و تحلیل با برش خواندن و کنترل کیفیت شروع می شود، به دنبال آن تراز خواندن با ژنوم مرجع و پیش بینی circRNA های جدید، همراه با شناسایی circRNA های شناخته شده از پایگاه های داده انجام می شود. اهداف miRNA مربوطه و میزبان‌های circRNA متعاقباً شناسایی می‌شوند. تجزیه و تحلیل بیان دیفرانسیل، circRNA های متفاوت بیان شده را نشان می دهد، و میزبان های مربوطه به طور عملکردی حاشیه نویسی می شوند تا توابع بیولوژیکی غنی را استخراج کنند.