Pacbio Luze osoko transkriptoma

PacBio Full-Length Transcriptome Sequencing-ek, Isoseq-ek, transkripzio-isoformen identifikazio zehatza ahalbidetzen du, poliadenilazio eta splicing alternatiboak argitzen ditu eta gene-adierazpenaren azterketa zehatzagoa egiten du. BMKCloud PacBio Full-Length Transcriptome kanalizazioa Circular Consensus Sequencing (CCS) moduan sekuentziatutako cDNA liburutegiak aztertzeko diseinatuta dago eta Full-Length Non-Chimeric (FLNC) sekuentziak identifikatzen ditu, ondoren erredundanteak ez diren transkripzioetan biltzen direnak. Ondorengo BUSCO analisi batek transkriptomiaren muntaketaren osotasuna ebaluatzen du. Transkriptoma muntatutik, analisi anitz egiten dira: splicing alternatiboa, sekuentzia errepikapen sinplea (SSR), lncRNAren eta dagozkien xede-geneen iragarpena, gene berrien iragarpena, gene-familiaren analisia, transkripzio-faktoreen analisia eta transkripzioen oharpen funtzionala.