MRNA-SEQ (NGS) erreferentzia genomarekin
RNA-SEQ tresna eta laborantza zientzien inguruko tresna estandarra da, genomak eta proteomak arteko hutsunea jorratzen du. Bere indarra transkripzio berriak ezagutzean eta bere adierazpena kupela batean kuantifikatzea da. Ikasketa transkriptomiko konparatuetarako oso erabilia da, hainbat ezaugarri edo fenotipoekin lotutako geneei buruzko argia botatzen duena, mutanteak basatiak edo geneen adierazpenak baldintza zehatzetan alderatzea bezala. BMKCloud MRNA (Erreferentzia) aplikazioak adierazpenen kuantifikazioa, adierazpen diferentziala (DEG) integratzen du eta sekuentziaren egiturak MRNA-SEQ (NGS) bioinformatikaren hoditeria bioinformatikoan aztertzen du eta antzeko softwarearen indarguneak amalgamatzen ditu, erosotasuna eta erabiltzaile-adiskidetasuna bermatuz. Erabiltzaileek RNA-SEQ datuak hodeira igo ditzakete, non aplikazioak azterketa bioinformatiko bakarreko konponbide integrala eskaintzen du. Gainera, bezeroaren esperientzia lehenesten du, erabiltzaileen beharretara egokitutako eragiketa pertsonalizatuak eskainiz. Erabiltzaileek parametroak ezar ditzakete eta kanalizazio-misioa beren kabuz bidali, txosten interaktiboa egiaztatu, datuak / diagramak ikusi eta datu-meatzaritza osoa, esaterako: xede genearen aukeraketa, klusterizazio funtzionala, diagramak eta abar.
Plataforma:Illumina, MGi
Estrategia:Rna-seq
Diseinu: Paredatutakoak, garbitzeko datuak.
Liburutegi mota:fr-gracked, fr-firststrand edo fr-shonstrand
Irakurri luzera:150 BP
Fitxategi mota:* .fastq, * .fq, * .fastq.gz edo * .fq.gz. Sistemak egingo duautomatikoki parekatu .fastq fitxategiak zure fitxategi izenen arabera,adibidez * _1.Fastq * ._ 2.Fastq parekatuta.
Lagin kopurua:Ez dago zenbakirik murrizketariklaginak, baina azterketa-denbora handitu egingo daLaginak hazten dira.
Gomendatutako datuen zenbatekoa:6G lagin bakoitzeko