mRNA-seq (NGS) - Berria

mRNA sekuentziatzeak zeluletako mRNA transkripzio guztien profilak egiteko aukera ematen du baldintza zehatzetan eta asko erabiltzen den teknologia da hainbat ikerketa-eremutan. BMKCloud De novo mRNA-seq kanalizazioa poly-A aberastutako sekuentziazio-liburutegiak aztertzeko diseinatuta dago erreferentziako genoma eskuragarri ez dagoenean. Kanalizazioa kalitate kontrolarekin hasten da, eta ondorende novotranskripzioaren muntaia eta unigene multzoen hautaketa. Egitura unigenoaren analisiak kode-sekuentzia (CDS) eta sekuentzia sinpleko errepikapenak (SSR) aurreikusten ditu. Ondoren, adierazpen diferentzialaren analisiak probatutako baldintzen artean modu ezberdinean adierazitako geneak (DEG) aurkitzen ditu, eta ondoren, oharpen funtzionala eta DEGak aberasten ditu ikuspegi biologikoak ateratzeko.