Metagenomikoak (NGS)

Eskopetaren metagenomikak Illagina-rekin tresna ezaguna da mikrobiomak ikasteko, DNA lagin konplexuen bidez zuzenean sekuentziatuz, aniztasun taxonomiko eta funtzionalaren azterketa ahalbidetuz. BMKCLOUD metagenomikoak (NGS) kanalizazioari kalitate kontrolarekin eta metagenomaren batzarrarekin hasten da, eta horietatik geneak iragartzen dira eta datu base ugari erabiliz funtzio eta taxonomiarako oharpenik gabeko datu-multzoetan aurreikusten dira. Informazio hau laginaren aniztasun taxonomikoa (Alpha Aniztasuna) eta laginaren aniztasunaren (beta aniztasuna) aztertzeko erabiltzen da. Taldeen arteko analisi diferentzialak bi taldeen artean desberdintzen diren bi taldeen artean ezberdintzen diren funtzio biologikoak aurkitzen ditu, bai azterketa parametrikoak eta ez parametrikoak erabiliz, eta korrelazioaren azterketak desberdintasun horiek ingurumen faktoreekin erlazionatzen ditu.