MRNA EUKARIOIKOEN AZTERKETA (Erreferentzia oinarritutako eta de novo aukerak eskuragarri daude)
Hoditeria honek NGS RNA-SEQ datuak erabiltzen ditu sarrera gisa eta beheranzko analisi anitzetako emaitzak sortzen ditu, baina ez dira mugatu: datuen kalitatearen ebaluazioa,de novoTranskripzio gunearen oharpena, aldagaiaren azterketa aldakorra, adierazpen diferentzialaren analisia, funtzioen oharpena eta aberasteko analisia.
ZORIONAK EZ ERABAKI ARGAZKI AZTERKETA
Zabor ez diren RNAS (LNCRNA) luzea da kodetzeak ez diren kodetzeak 200 NT baino luzeagoak dituzten eta kromatiko antolaketa eta erregulazioan rolak ezagutzen ditu. Goi-mailako sekuentziazio teknologiak eta bioinformatikoak gure ulermena lortu dute LNCRNA sekuentziak eta kokapen informazioa LNCRNak arautze funtzio garrantzitsuekin identifikatzeko. Hoditeria honek LNCRNAren azterketa eskaintzen du MRNA azterketa eukariotikoen analisian aipatutako analisiekin gain.
16s / 18s / Bere anplicon sekuentziazioa
Mikrobioen aniztasunaren analisi-analisia pipelina mikrobioen aniztasun proiektuaren azterketan oinarrituta garatu zen. Hoditeria oinarrizko analisi normalizatua dauka, gaur egungo mikrobioen ikerketa eta azterketa pertsonalizatuen azterketa nagusiak estaltzen dituena. Analisiaren txostena aberatsa eta integrala da, analisi pertsonal askotariko aukera izan dezan. Gainera, laginak eta taldeak hegan alda daitezke pertsonalizazio eta kontrol gehiagorako.
Eskopetaren metagenomikaren azterketa
Eskopetaren analisi metagenomikoen kanalizazioak NGS datuak erabiltzen ditu ingurumen laginetatik ateratako material genomiko mistoetatik. Analisiek espezieei buruzko informazio zehatza eskaintzen dute, biztanleriaren egitura, biztanleriaren egitura, harreman filoogenetikoa, gene funtzionalak eta korrelazio sareak ingurumen-faktoreekin.
NGS-WGS aldaera analisia
NGS-WGS aldaera analisia datuen kalitatearen kontrola, sekuentzia lerrokatzea, oharpena eta gene mutazioen analisia egiten dituen aldaera hautemateko kanalizazio integratua da. Hoditeria SNP eta Indel detekziorako praktika onenak jarraitzen ditu eta Manta erabiltzen du egiturazko aldaera deitzeko.
Genoma zabaleko elkartearen azterketa (GWAS)
GWAS PIPELINA Beheko analisia da, aurretik sortutako VCF fitxategiak eta dagozkien fenotipo datuak, gizabanakoen sarrera gisa. Estatistika-metodologia zehatzak erabiliz, GWAk desberdintasun fenotipikoekin erlazionatutako nukleotidoen aldakuntzak deskubritzea du helburu. Erail garrantzitsua da giza gaixotasun konplexuekin lotutako gene funtzionalak esploratzeko eta landare eta animalietan ezaugarri korapilatsuak aztertzen.
Ontzien segregazioen analisia (BSA)
BSAren azterketak biztanleria segregatzaile baten muturreko ezaugarri fenotipikoak dituzten pertsonak igotzea dakar. Bildutako laginen artean kokapen diferentziak alderatuz, ikuspegi honek xede geneekin lotutako markatzaile molekularrak estuki lotuta identifikatzen ditu. Landareen eta animalien mapa genetikoan oso erabilia da, lagundutako ugalketa egiteko tresna baliotsua da.
Genetikaren azterketa ebolutiboa
Genetikaren analisi ebolutiboak BMKGene-ren eskarmentu handia du bilakaera genetikoko proiektuetan, eta zuhaitz filogenetikoen eraikuntza, lotura desatseginaren azterketa, aniztasun genetikoaren ebaluazioa, identifikazio selektiboa, ahaideen analisia, osagaien azterketa nagusia eta biztanleriaren egituraren ezaugarria ditu.
