Exclusive Agency for Korea

BMKCloud Hasi saioa

Aurrealdi

DNA / RNA sekuentziazioa - Nanopore sekuentziadorea

Ont sekuentziazioa denbora errealean molekula bakarra da, nanoporoetan oinarritutako seinale elektrikoaren sekuentziazio teknologia, plataforma bakoitzaren sekuentziazio printzipioa berdina da. DNA / RNA bikoitza biofilmean barneratutako proteina nanoporoetara lotuko da eta motor proteinen buruan sartu gabe. Biofilmaren bi aldeetako tentsioaren aldaketaren arabera, DNA / RNA-kateak nanopore kanalaren proteina batetik bestera pasatzen dira tasa. Oinarri desberdinetako propietate kimikoen desberdintasunak direla eta DNA / RNA katearen gainean, oinarri edo DNA molekula bakarra nanopore kanaletik igarotzen denean, seinale elektriko desberdinen aldaketa eragingo du. Seinale horiei detektatu eta dagozkien oinarrizko oinarri mota kalkulatuz, eta sekuentzia betetzeko denbora erreala bete daiteke.

Jar zaitez gurekin harremanetan

Zerbitzuaren xehetasunak

Demo emaitza

Zerbitzuaren xehetasunak Ezaugarriak

Nasa	Liburutegiaren tamaina	Datuen etekin teorikoa (zelula bakoitzeko)	Oinarri bakarreko zehaztasuna	Eska
Nanopore	8kb, 10kb, 20kb, Ultralong, CDNA-PCR	70-90GB / gelaxka	% 85-92	SV Deiak, De Novo, luzera osoko sekuentziazioa, ISO-seq, genearen oharpena, DNAren metilazioa hautematea

Zerbitzuaren abantailak

● 5 urtetik gorako esperientzia Pacbio sekuentziazio plataforman milaka proiektu dituzten milaka espezieekin.
● BMKGENE Oxford Nanopore-ren bazkide ofiziala da, RNA / DNA ziurtagiria duen plataforma bikoitzarekin.
● Ekipamendu osoak dituzten sekuentzialen eredu nagusiak eta sekuentziazio nahikoa dutenak daude.
● Nanopore plataforman oinarrituta, nazioartean ospe handiko aldizkarietan argitaratu dira Denovo-ren 10 animalia eta landare ikerketa.

Laginaren baldintzak

Lagin mota

Kopuru

Kontzentrazioa (QUBIT ®)

Ozentasun

Garbitasun

Beste

Genomic DNA

Datuen eskakizunaren araberakoa da

≥20ng / μl

≥15μl

Od260 / 280 = 1,7-2.2;

OD260 / 230≥1.5;

Garbitu gailurra 260 nm-tan, kutsadurarik ez

Kontzentrazioa Qubb and Qubb / Nanopore-k neurtu behar du ≤ 2

Guztira RNA

≥1.2μg

≥100μg / μl

≥15μl

Od260 / 280 = 1,7-2.5;

Od260 / 230 = 0,5-2,5; kutsadurarik ez

Rin balioa ≥7.5

Zerbitzuaren fluxua

Laginak prestatzea

Liburutegiko eraikuntza

Sekuentziazio

Datuen azterketa

Proiektua Bidalketa

Aurrekoa: Illumina aurrez egindako liburutegiak

Hurrengoa: Berariazko-lokala zatien sekuentziazio anplifikatua (SLAF-SEQ)

DNA laginaren datuen kalitatea ebaluatzea

1. taula. Datu garbiei buruzko estatistikak.

Bmkid	rawseqnum	RawBsaBrase	cleanseqnum	CleanSumbase	cleann50len	cleann90len	cleanmeanlen	cleanmaxlen	CleanMeanqual
DNA_BMK01	1.218.239	26,37	1.121.736	25,90	28.014	15.764	23.090	143.181	9