Amplicon Sequencing (16s / 18s / ITS)

Amplicon (16s / 18s / ITS) Sekuentziazioa mikrobioen aniztasuna aztertzeko metodoa da, mikrobioen profilak identifikatuz haien sekuentzien arabera eta gero, lagin bakoitzaren eta laginen artean komunitatearen aberastasuna eta aniztasuna deszifratzen saiatzen da. BMKCLOUD anplicon (NGS) kanalizazioak 16, 18 urte, bere gene funtzional anitz eta anitzeko analisia ahalbidetzen du. Irakurketa mozteko, parekatutako irakurtzeko muntaketa eta kalitatea ebaluatzen hasten da eta jarraian, sei azterketa desberdinetan erabiltzen diren unitate taxonomikoen (OTUS) sortutako antzeko irakurketak biltzen ditu. Oharpen taxonomikoek lagin bakoitzaren ugaritasun eta konposizio erlatiboari buruzko informazioa ematen dute, alfa eta beta aniztasunak analisi mikrobioen eta laginen artean, hurrenez hurren. Taldeen arteko analisi diferentzialak proba parametrikoak eta parametrikoak erabiliz desberdinak diren OTUS aurkitzen du, eta korrelazioaren analisiak desberdintasun horiek ingurumen-faktoreekin erlazionatzen ditu. Azkenik, genearen ugaritasun funtzionala aurreikusten da gene ugaritasunean oinarrituta, lagin bakoitzean funtzio eta ekologia ezagutzea.