Heatmap sahtlit kasutatakse soojuskaardi joonistamiseks, mis võimaldab filtreerida, normaliseerida ja klasterdada maatriksi andmeid. Seda kasutatakse enamasti erinevate proovide vahelise geeniekspressiooni taseme klasteranalüüsiks.
Bioloogiliste funktsioonide lisamine FASTA-faili järjestustele, joondades järjestused andmebaasiga, sealhulgas NR, KEGG, COG, SwissProt, TrEMBL, KOG, Pfam.
BLAST (Basic Local Alignment Search Tool) on algoritm ja programm sarnaste bioloogiliste järjestustega piirkondade leidmiseks. See võrdleb neid järjestusi järjestuste andmebaasidega ja arvutab statistilise olulisuse. BLAST koosneb nelja tüüpi tööriistadest, mis põhinevad järjestuse tüübil: blastn, lastp, blastx ja tblastn.