Väike RNA

Väikesed RNA-d on lühikesed mittekodeerivad RNA-d, mille keskmine pikkus on 18-30 nt, sealhulgas miRNA, siRNA ja piRNA, mis mängivad olulist rolli regulatsiooniprotsessides. BMKCloud sRNA torujuhe pakub miRNA tuvastamiseks nii standardset kui ka kohandatud analüüsi. Pärast lugemise kärpimist ja kvaliteedikontrolli joondatakse lugemised sRNA-de klassifitseerimiseks ja miRNA-de valimiseks mitme andmebaasiga ning kaardistatakse võrdlusgenoomiga. miRNA-d tuvastatakse teadaolevate miRNA andmebaaside põhjal, pakkudes teavet sekundaarse struktuuri, miRNA perekonna ja sihtgeenide kohta. Diferentsiaalekspressioonianalüüs tuvastab erinevalt ekspresseeritud miRNA-d ja vastavad sihtgeenid on funktsionaalselt annoteeritud, et leida rikastatud kategooriaid.