Integreeritud lähenemisviisid mikrobiomi analüüsis
- Nukleiinhapete ekstraheerimisest kuni järjestustehnoloogiateni
Mikroobsete kogukondade suure läbilaskevõimega järjestamisuuringud on muutunud laialt levinud ja on märkimisväärselt arenenud meie arusaamist inim-, keskkonna- ja loomade mikrobiomist.
Selles veebiseminaris arutab Biomarker Technologies välirakendusteadlane Ana Vila-Santa kahte mikrobiomiuuringute jaoks olulist alust sekveneerimismeetodit: amplikoni sekveneerimine ja püssirelva metagenoomika. Ta juhendab meid lühikese lugemise (nt Illumina) ja pikaajalise (nt Nanopore, Pacbio) järjestamistehnoloogiate võrdleva analüüsi kaudu, hinnates nende tulemuslikkust erinevates uuringuesmärkides.
Pärast seda siirdub Tiangeni ekspordituru meeskonna tootejuht dr Cui automatiseeritud nukleiinhapete ekstraheerimislahenduste edusammudele. Ta uurib mikroorganismi proovidega seotud põhimõtteid, meetodeid ja väljakutseid, kulmineerudes kaasaegse automatiseeritud nukleiinhappe ekstraheerimise (NAE) platvormi kasutuselevõtu kasutuselevõtuga. Dr CUI annab põhjaliku ülevaate Tiangeni põhjalikust lahendusest proovide ettevalmistamise ja nukleiinhappe analüüsi jaoks mikrobiomi uuringutes, käsitledes tulevasi väljakutseid ja parandusi.