Metangenoomika (NGS)

Shotgun Metagenoomika koos Illuminaga on populaarne vahend mikrobioomide uurimiseks, sekveneerides DNA -d keerukatest proovidest, võimaldades uurida nii taksonoomilist kui ka funktsionaalset mitmekesisust. BMKCLOUD metagenoomse (NGS) torujuhtmega algab kvaliteedikontrolli ja metagenoomi komplektiga, millest geene ennustatakse ja koondatakse mitteredukantseteks andmekogumiteks, mis on funktsioonide ja taksonoomia jaoks märkused, kasutades mitut andmebaasi. Seda teavet kasutatakse valimisisese taksonoomilise mitmekesisuse (alfa mitmekesisuse) ja proovidevahelise mitmekesisuse (beeta mitmekesisuse) analüüsimiseks. Rühmade vaheline diferentsiaalne analüüs leiab OTU ja bioloogilisi funktsioone, mis erinevad kahe rühma vahel, kasutades nii parameetrilisi kui ka mitteparameetrilisi teste, samas kui korrelatsioonianalüüs seostab neid erinevusi keskkonnateguritega.