Pikk mittekodeeriv järjestus-illumool
Teenuse eelised
●MRNA ja lncRNA ühine analüüs: Kombineerides mRNA transkriptide kvantifitseerimise lncRNA ja nende sihtmärkide uurimisega, on võimalik saada põhjalik ülevaade rakulise vastuse aluseks olevast regulatiivsest mehhanismist.
●Ulatuslik teadmine: Meie meeskond toob igasse projekti hulga kogemusi, kusjuures BMK -s on mitmekesiste proovide ja LNCRNA projektide töötlemise kogemus üle 23 000 proovi.
●Range kvaliteedikontroll. See hoolikas seire tagab pidevalt kvaliteetsete tulemuste kohaletoimetamise.
●Müügijärgne tugi: Meie pühendumus ulatub kaugemale projekti lõpuleviimisest 3-kuulise müügijärgse teenindusperioodiga. Selle aja jooksul pakume projekti järelmeetmeid, tõrkeotsingu abi ja küsimuste ja vastuste seansse tulemustega seotud päringute lahendamiseks.
Proovi nõuded ja kohaletoimetamine
| Raamatukogu | Platvorm | Soovitatavad andmed | Data QC |
| rRNA ammendatud suunaraamatukogu | Illumina PE150 | 10-16 GB | Q30 ≥85% |
Nukleotiidid:
| Konts (ng/μl) | Kogus (μg) | Puhtus | Terviklikkus |
| ≥ 80 | ≥ 0,8 | OD260/280 = 1,7-2,5 OD260/230 = 0,5-2,5 Geelil näidatud piiratud või puudub valk või DNA saastumine. | Rin≥6,0; 5,0 ≥28S/18S≥1,0; Piiratud või puudub algtaseme kõrgus |
● Taimed:
Juur, vars või kroonlehe: 450 mg
Leht või seeme: 300 mg
Puu: 1,2 g
● Loom:
Süda või sool: 450 mg
Siseelundite või aju: 240 mg
Lihas: 600 mg
Luud, juuksed või nahk: 1,5 g
● lülijalgsed:
Putukad: 9G
Crustacea: 450 mg
● Terve veri:2 toru
● rakud: 106 rakud
● Seerum ja plasma: 6 ml
Soovitatav proovi kohaletoimetamine
Konteiner: 2 ml tsentrifuugitoru (tinafooliumi ei soovitata)
Proovide märgistamine: rühm+kopeerige nt A1, A2, A3; B1, B2, B3.
Saadetis:
1. Kuiv-jää: proovid tuleb pakkida kottidesse ja matta kuiva jää.
2. RNABABLE torud: RNA -proove saab kuivatada RNA stabiliseerimistorus (nt RNAstanble®) ja viia toatemperatuuril.
Teeninduse töövool
Katse kavandamine
Proovi kohaletoimetamine
RNA ekstraheerimine
Raamatukogu ehitamine
Sekveneerimine
Andmeanalüüs
Müügijärgsed teenused
Bioinformaatika
Diferentsiaalse geeniekspressiooni (DEGS) analüüs
LncRNA ekspressiooni kvantifitseerimine - klastrimine
LnCRNA sihtgeenide rikastamine
Ühine mRNA ja LnCRNA positsiooni analüüs - tsirkuste graafik (keskmine ring on mRNA ja sisemine CICRLCE on lncRNA)
Uurige BMKGENE LNCRNA Equencing Services'i hõlbustatud edusamme kureeritud väljaannete kogumise kaudu.
Ji, H. jt. (2020) „Külma stressiga seotud lncRNA-de tuvastamine, funktsionaalne ennustamine ja võtme LNCRNA kontrollimine rottide maksas”, teaduslikud aruanded 2020 10: 1, 10 (1), lk 1–14. doi: 10.1038/S41598-020-57451-7.
Jia, Z. jt. (2021) „Integreeriv transkriptoomiline analüüs näitab tsükli-3-vastuse tavalise karpkala tüve immuunmehhanismi”, piirid immunoloogias, 12, lk. 687151. Doi: 10.3389/fimmU.2021.687151/Bibtex.
Wang, XJ jt. (2022) „Konkureerivate endogeensete RNA reguleerimisvõrkude multiomics integratsioonipõhine prioriteetide seadmine väikese raku kopsuvähi korral: molekulaarsed omadused ja ravimikandidaadid”, onkoloogia piirid, 12, lk. 904865. Doi: 10.3389/fonc.2022.904865/Bibtex.
Xiao, L. jt. (2020) „Populus fotosünteesi aluseks oleva geeni kooseekspressioonivõrgu geneetiline dissektsioon”, Plant Biotechnology Journal, 18 (4), lk 1015–1026. doi: 10.1111/pbi.13270.
Zheng, H. jt. (2022) „Globaalne regulatiivne võrk düsreguleeritud geeniekspressiooni ja ebanormaalse metaboolse signaalimise kohta immuunrakkudes haudade haiguse mikrokeskkonnas ja Hashimoto türeoidiit”, piirid immunoloogias, 13, lk. 879824. Doi: 10.3389/fimmU.2022.879824/Bibtex.
