Evolutsiooniline geneetika

Evolutsiooniliste geneetiliste uuringute eesmärk on mõista populatsioonide evolutsioonilist trajektoori, kasutades genoomijärjestustes polümorfismi teavet. BMKCloudi evolutsioonilise geneetika torujuhtme on loodud analüüsimiseks suurte populatsioonide WGS-i või spetsiifilise lookuse amplifitseeritud fragmendi (SLAF) andmete analüüsimiseks. Pärast töötlemata andmete kvaliteedikontrolli joondatakse lugemised võrdlusgenoomiga ja kutsutakse variante. Torujuhtme sisaldab fülogeneetilise puu konstruktsiooni, põhikomponentide analüüsi (PCA), populatsiooni struktuuri analüüsi, ahelate tasakaalustamatuse (LD), selektiivse pühkimise analüüsi ja kandidaatide geenianalüüsi.