DNBSEQ eelvalmistatud teegid
Omadused
●Platvorm:MGI-DNBSEQ-T7
●Järjestusrežiimid:PE150
●Illumina raamatukogude ülekandmine aadressileMGI:võimaldab suurte andmemahtude järjestamist madalate kuludega.
●Teekide kvaliteedikontroll enne sekveneerimist.
●Andmete järjestus QC ja kohaletoimetamine:QC aruande ja töötlemata andmete edastamine fastq-vormingus pärast demultipleksimist ja Q30 lugemiste filtreerimist.
Eelised
●Järjestusteenuste mitmekülgsus:klient võib valida järjestuse raja või andmemahu järgi.
●Kõrge andmeväljund:1500 Gb/rada
●Järjestuse kvaliteedikontrolli aruande kohaletoimetamine:kvaliteedimõõdikute, andmete täpsuse ja järjestusprojekti üldise jõudlusega.
●Küpse järjestusprotsess:lühikese pöördeajaga.
●Range kvaliteedikontroll: rakendame rangeid kvaliteedikontrolli nõudeid, et tagada püsivalt kvaliteetsete tulemuste saavutamine.
Näidisnõuded
| Andmemaht (X) | Kontsentratsioon (qPCR/nM) | Helitugevus | |
| Osaline sõidurada
| X ≤ 10 Gb | ≥ 1 nM | ≥ 25 μl |
| 10 Gb < X ≤ 50 Gb | ≥ 2 nM | ≥ 25 μl | |
| 50 Gb < X ≤ 100 Gb | ≥ 3 nM | ≥ 25 μl | |
| X > 100 Gb | ≥ 4 nM | ||
| Üks sõidurada | Per Lane | ≥ 1,5 nM / raamatukogu kogum | ≥ 25 μl / raamatukogu bassein |
Lisaks kontsentratsioonile ja üldkogusele on vajalik ka sobiv piigi muster.
Märkus. Madala mitmekesisusega teekide radade järjestamiseks on vaja PhiX-i spike-in, et tagada tugev baaskõne.
Soovitame esitada näidistena eelpoolühendatud teegid. Kui soovite, et BMKGENE teegi ühendaks, vaadake palun
teegi nõuded osaliste radade järjestamiseks.
Raamatukogu suurus (tippkaart)
Põhipiik peaks olema vahemikus 300–450 bp.
Raamatukogudel peaks olema üks põhipiik, adapteri saastumine ja praimeri dimeerid.
Teeninduse töövoog
Raamatukogu kvaliteedikontrolli aruanne
Aruanne raamatukogu kvaliteedi kohta esitatakse enne järjestamist, raamatukogu hulga ja killustatuse hindamist.
Järjestuse kvaliteedikontrolli aruanne
Tabel 1. Järjestusandmete statistika.
| Näidis ID | BMKID | Toores lugemine | Toorandmed (bp) | Puhtad lugemised (%) | Q20 (%) | K30 (%) | GC (%) |
| C_01 | BMK_01 | 22 870 120 | 6 861 036 000 | 96,48 | 99.14 | 94,85 | 36,67 |
| C_02 | BMK_02 | 14 717 867 | 4 415 360 100 | 96.00 | 98,95 | 93,89 | 37.08 |
Joonis 1. Kvaliteedi jaotus igas proovis
Joonis 2. Põhisisu jaotus
Joonis 3. Loetud sisu jaotus sekveneerimisandmetes
