TsircRNA

Ümmargused RNA-d (tsircrNA-d) on mittekodeerivad RNA-d, mis moodustavad ümmargused struktuurid ja millel on mitu regulatiivset rolli, sealhulgas konkureerivad miRNA-ga sihtgeenide ja valkude sidumise korral. BMKCLOUD CircrNA torujuhtme on loodud rRNA ammendatud raamatukogude analüüsiks hästi märkanud ja kvaliteetse võrdlusgenoomiga. Analüüs algab lugemise kärpimise ja kvaliteedikontrolliga, millele järgneb lugemise joondamine võrdlusgenoomiga ja uudsete tsircRNA -de ennustamisega koos andmebaaside teadaolevate tsircRNA -de tuvastamisega. Seejärel tuvastatakse vastavad miRNA sihtmärgid ja tsircRNA hostid. Diferentsiaalse ekspressiooni analüüs näitab diferentseeritult ekspresseeritud tsircRNA -sid ja vastavad peremehed on funktsionaalselt märkused, et ekstraheerida rikutud bioloogilisi funktsioone.