WGS (Nanoporo)

La resecuenciación del genoma completo con Nanopore es un método popular para identificar variantes genómicas, particularmente variantes estructurales (SV), que se denominan con mayor precisión mediante secuenciación de lectura larga que mediante secuenciación de lectura corta. La canalización BMKCloud TGS-WGS (Nanopore) está diseñada para analizar datos de proyectos WGS con Nanopore utilizando un genoma de referencia bien anotado y de alta calidad. El análisis comienza con el recorte de lectura y el control de calidad, seguido de la alineación con el genoma de referencia, la llamada de SV y la anotación funcional de genes asociados a SV utilizando múltiples bases de datos.