
ARN pequeño
Los ARN pequeños son ARN no codificantes cortos con una longitud promedio de 18-30 nt, incluidos miRNA, siRNA y piRNA, que juegan un papel importante en los procesos regulatorios. La tubería SRNA BMKCloud proporciona análisis estándar y personalizado para la identificación de miARN. Después de leer el recorte y el control de calidad, las lecturas están alineadas con múltiples bases de datos para clasificar los ARN y seleccionar miRNAs y asignarse al genoma de referencia. Los miRNA se identifican en base a bases de datos de miRNA conocidas, proporcionando información sobre la estructura secundaria, la familia de miRNA y los genes objetivo. El análisis de expresión diferencial identifica miARN expresados diferencialmente y los genes objetivo correspondientes se anotan funcionalmente para encontrar categorías enriquecidas.
Flujo de trabajo bioinformático
