Pacbio Transcriptoma completo

La secuenciación de transcriptomas de longitud completa de PacBio, Isoseq, permite la identificación precisa de isoformas de transcripción, lo que arroja luz sobre la poliadenilación y el empalme alternativos y conduce a un análisis de expresión genética más preciso. El proceso de transcriptoma de longitud completa de BMKCloud PacBio está diseñado para analizar bibliotecas de ADNc secuenciadas en modo de secuenciación por consenso circular (CCS) e identifica secuencias no quiméricas de longitud completa (FLNC), que luego se agrupan en transcripciones no redundantes. Un análisis BUSCO posterior evalúa la integridad del ensamblaje del transcriptoma. A partir del transcriptoma ensamblado, se realizan múltiples análisis: empalme alternativo, repetición de secuencia simple (SSR), predicción de lncRNA y genes diana correspondientes, predicción de genes nuevos, análisis de familias de genes, análisis de factores de transcripción y anotación funcional de transcripciones.