mRNA-seq (NGS) con genoma de referencia
RNA-seq es una herramienta estándar en las ciencias de la vida y los cultivos, que cierra la brecha entre genomas y proteomas. Su fortaleza radica en descubrir nuevas transcripciones y cuantificar su expresión en un solo ensayo. Se usa ampliamente para estudios transcriptómicos comparativos, arrojando luz sobre genes relacionados con diversos rasgos o fenotipos, como comparar mutantes con tipos salvajes o revelar la expresión genética en condiciones específicas. La aplicación BMKCloud mRNA (Reference) integra la cuantificación de expresión, el análisis de expresión diferencial (DEG) y los análisis de estructura de secuencia en el proceso bioinformático mRNA-seq (NGS) y fusiona las fortalezas de software similar, garantizando conveniencia y facilidad de uso. Los usuarios pueden cargar sus datos de RNA-seq en la nube, donde la aplicación ofrece una solución de análisis bioinformático integral e integral. Además, prioriza la experiencia del cliente, ofreciendo operaciones personalizadas y adaptadas a las necesidades específicas de los usuarios. Los usuarios pueden establecer parámetros y enviar la misión del proceso por sí mismos, consultar el informe interactivo, ver datos/diagramas y completar la extracción de datos, como: selección de genes objetivo, agrupamiento funcional, diagramación, etc.
Plataforma:Illumina, MGI
Estrategia:Sec. de ARN
Disposición: Datos pareados y limpios.
Tipo de biblioteca:fr-unstranded, fr-firststrand o fr- secondstrand
Longitud de lectura:150 pb
Tipo de archivo:*.fastq, *.fq, *.fastq.gz o *.fq.gz. El sistemaempareje automáticamente los archivos .fastq según sus nombres de archivo,por ejemplo, *_1.fastq emparejado con *._2.fastq.
Número de muestras:No hay restricciones en el número.de muestras, pero el tiempo de análisis aumentará a medida que aumente el número delas muestras crecen.
Cantidad de datos recomendada:6G por muestra