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Misceláneo, una planta perenne rizomatosa, tiene un gran potencial para la producción de bioenergía para su alta biomasa y tolerancia al estrés. Reportamos un ensamblaje a escala cromosómica deMiscanthus lutarioripariusGenoma combinando secuenciación de nanoporos de Oxford y tecnologías HI-C. El ensamblaje de 2.07 GB cubre el 96.64% del genoma, con contig N50 de 1.71 MB. Las secuencias de centrómero y telómero se ensamblan para los 19 cromosomas y cromosomas 10, respectivamente. El origen alotetraploide del M. lutarioriparius se confirma utilizando repeticiones satelitales centroméricas. La estructura del genoma tetraploide y varios reordenamientos cromosómicos en relación con el sorgo se demuestran claramente. Genes duplicados en tándem deM. lutarioripariusestán enriquecidos funcionales no solo en términos relacionados con la respuesta al estrés, sino la biosíntesis de la pared celular. Las familias genéticas relacionadas con la resistencia a las enfermedades, la biosíntesis de la pared celular y el transporte de iones de metal se expanden y evolucionan en gran medida. La expansión de estas familias puede ser una base genómica importante para la mejora de rasgos notables deM. Lutarioriparius.