secuenciación de ARNm (NGS) – De novo

La secuenciación de ARNm permite perfilar todas las transcripciones de ARNm en células en condiciones específicas y es una tecnología ampliamente utilizada en diversas áreas de investigación. La tubería BMKCloud De novo mRNA-seq está diseñada para analizar bibliotecas de secuenciación enriquecidas con poli-A cuando no hay un genoma de referencia disponible. El proceso comienza con el control de calidad, seguido dede novoensamblaje de transcripción y selección de conjunto unigene. El análisis de la estructura unigene predice la secuencia codificante (CDS) y las repeticiones de secuencia simple (SSR). Posteriormente, el análisis de expresión diferencial encuentra genes expresados ​​diferencialmente (DEG) entre las condiciones probadas, seguido de la anotación funcional y el enriquecimiento de los DEG para extraer conocimientos biológicos.