
Metagenómica (NGS)
La metagenómica de escopeta con Illumina es una herramienta popular para estudiar microbiomas secuenciando directamente el ADN de muestras complejas, lo que permite el estudio de la diversidad taxonómica y funcional. La tubería metagenómica de BMKCloud (NGS) comienza con control de calidad y ensamblaje del metagenoma, a partir del cual los genes se predicen y se agrupan en conjuntos de datos no redundantes que se anotan para la función y la taxonomía utilizando múltiples bases de datos. Esta información se utiliza para analizar la diversidad taxonómica dentro de la muestra (diversidad alfa) y la diversidad entre muestras (diversidad beta). El análisis diferencial entre grupos encuentra OTU y funciones biológicas que difieren entre los dos grupos utilizando pruebas paramétricas y no paramétricas, mientras que el análisis de correlación relaciona estas diferencias con los factores ambientales.
Flujo de trabajo bioinformático
