lncRNA

Los ARN largos no codificantes (LNCRNA) son ARN más de 200 nucleótidos con bajo potencial de codificación pero con funciones reguladoras críticas. La tubería BMKCloud LnCRNA está diseñada para analizar bibliotecas agotadas de ARNr con un genoma de referencia de alta calidad y bien anotado, mediante el análisis de la expresión de LnCRNA y ARNm. Después de leer el recorte y el control de calidad, las lecturas se alinean con el genoma de referencia para ensamblar transcripciones, y el análisis posterior de la estructura génica revela empalme alternativo y genes novedosos. Las transcripciones se identifican como ARNm o lncRNA, y el análisis de expresión diferencial identifica LNCRNA expresados ​​diferencialmente, sus objetivos y genes (DEG) expresados ​​diferencialmente. Tanto los DEG y los objetivos LNCRNA expresados ​​diferencialmente se anotan funcionalmente para encontrar categorías funcionales enriquecidas.