El estudio de asociación de todo el genoma (GWAS) tiene como objetivo identificar variantes genéticas (genotipo) que se asocian con rasgos específicos (fenotipo). Los estudios de GWA investigan los marcadores genéticos cruzan el genoma completo de un gran número de individuos y predicen asociaciones de genotipo-fenotipo por análisis estadístico a nivel de población. La resequenciación del genoma completo puede descubrir todas las variantes genéticas. El acoplamiento con datos fenotípicos, GWAS se puede procesar para identificar SNP, QTL y genes candidatos relacionados con fenotipos, lo que respalda fuertemente la cría moderna de animales/plantas. SLAF es una estrategia de secuenciación del genoma simplificada autodesarrollada, que descubre marcadores distribuidos en todo el genoma, SNP. Estos SNP, como marcadores genéticos moleculares, pueden procesarse para estudios de asociación con rasgos dirigidos. Es una estrategia rentable en la identificación de rasgos complejos asociadas variaciones genéticas.