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Productos

Bibliotecas prepascadas de DNBSEQ

DNBSEQ, desarrollado por MGI, es una tecnología NGS innovadora que ha logrado disminuir aún más los costos de secuenciación y aumentar el rendimiento. La preparación de las bibliotecas DNBSEQ implica la fragmentación de ADN, la preparación de ssDNA y la amplificación del círculo rodante para obtener los nanoballs de ADN (DNB). Luego se cargan en una superficie sólida y posteriormente secuenciados por la síntesis de sondeo de sonda combinatoria (CPAS). La tecnología DNBSEQ combina las ventajas de tener una baja tasa de error de amplificación con el uso de patrones de error de alta densidad con nanoballs, lo que resulta en secuenciación con mayor rendimiento y precisión.

Nuestro servicio de secuenciación de la biblioteca prefabricado permite a los clientes preparar bibliotecas de secuenciación de Illumina de diversas fuentes (ARNm, genoma completo, amplicón, bibliotecas 10x, entre otras), que se convierten en bibliotecas MGI en nuestros laboratorios para ser secuenciados en DNBSEQ-T7, lo que permite Altos montos de datos a costos más bajos.


Detalles del servicio

Resultado de demostración

Características

Plataforma:Mgi-dnbseq-t7

Modos de secuenciación:PE150

Transferencia de bibliotecas de Illumina aMGI:habilitando la secuencia de altos volúmenes de datos a bajo costo.

Control de calidad de las bibliotecas antes de la secuenciación.

Datos de secuenciación QC y entrega:Entrega del informe de QC y datos sin procesar en formato FASTQ después de las lecturas de Demultiplexing y Filtrado Q30.

 

Ventajas

Versatilidad de los servicios de secuenciación:El cliente puede optar por secuencia por carril o cantidad de datos.

Alta salida de datos:1500 GB/carril

Entrega de secuenciación Informe de control de calidad:Con métricas de calidad, precisión de los datos y rendimiento general del proyecto de secuenciación.

Proceso de secuenciación madura:con breve tiempo de entrega.

Control de calidad riguroso: Implementamos requisitos estrictos de control de calidad para garantizar la entrega de resultados consistentemente de alta calidad.

 

Requisitos de muestra

 

Cantidad de datos (x)

Concentración (QPCR/NM)

Volumen

Carril parcial

   

X ≤ 10 GB

≥ 1 nm

≥ 25 μl

10 GB <x ≤ 50 GB

≥ 2 nm

≥ 25 μl

50 GB <x ≤ 100 GB

≥ 3 nm

≥ 25 μl

X> 100 GB

≥ 4 nm

 

Carril único

Por carril

≥ 1.5 nm / piscina de biblioteca

≥ 25 μl / piscina de biblioteca

Además de la concentración y la cantidad total, también se requiere un patrón máximo adecuado.

NOTA: La secuenciación de carril de bibliotecas de baja diversidad requiere Phix Spike-in para garantizar llamadas base robustas.

Recomendamos enviar bibliotecas prepoleadas como muestras. Si necesita que BMKGene realice la agrupación de la biblioteca, consulte el

Requisitos de la biblioteca para la secuenciación de carril parcial.

Tamaño de la biblioteca (mapa pico)

El pico principal debe estar dentro de 300-450 pb.

Las bibliotecas deben tener un solo pico principal, sin contaminación del adaptador y sin dímeros de cebador.

Flujo de trabajo de servicio

preparación de muestra-
Secuenciación
Análisis de datos
Muestra-QC

  • Anterior:
  • Próximo:

  • Informe de QC de la biblioteca

    Se proporciona un informe sobre la calidad de la biblioteca antes de secuenciar, evaluar el monto de la biblioteca y la fragmentación.

     

    Informe de QC de secuenciación

     

    Tabla 1. Estadísticas sobre datos de secuenciación.

    ID de muestra

    Bmkid

    Lecturas crudas

    Datos sin procesar (BP)

    Lecturas limpias (%)

    Q20 (%)

    Q30 (%)

    GC (%)

    C_01

    BMK_01

    22,870,120

    6,861,036,000

    96.48

    99.14

    94.85

    36.67

    C_02

    BMK_02

    14,717,867

    4,415,360,100

    96.00

    98.95

    93.89

    37.08

    Figura 1. Distribución de calidad a lo largo de lecturas en cada muestra

    A9

    Figura 2. Distribución de contenido base

    A10

    Figura 3. Distribución de contenidos de lectura en datos de secuenciación

    A11

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