Bibliotecas prefabricadas de Illumina
Características
●Plataformas:Illumina NovaSeq 6000 y NovaSeq X Plus
●Modos de secuenciación:PE150 y PE250
●Control de calidad de bibliotecas antes de la secuenciación.
●Control de calidad y entrega de datos de secuenciación:entrega de informes de control de calidad y datos sin procesar en formato fastq después de demultiplexar y filtrar lecturas Q30
Ventajas del servicio
●Versatilidad de los servicios de secuenciación:el cliente puede optar por secuenciar por carril, celda de flujo o por cantidad de datos requeridos (secuenciación de carril parcial).
●Amplia experiencia en plataforma de secuenciación Illumina:con miles de proyectos cerrados con diversas especies.
●Entrega del informe de control de calidad de secuenciación:con métricas de calidad, precisión de los datos y rendimiento general del proyecto de secuenciación.
●Proceso de secuenciación maduro:con un corto tiempo de respuesta.
●Control de calidad riguroso: implementamos estrictos requisitos de control de calidad para garantizar la entrega de resultados consistentes de alta calidad.
Plataformas de muestra
| Plataforma | Celda de flujo | Modo de secuenciación | Unidad | Producción estimada |
| NovaSeqX | 10B (8 carriles) | PE150 | Carril único Carril parcial | 375Gb/carril |
| 25B (8 carriles) | PE150 | Carril único Carril parcial | 1000 Gb/carril | |
| NovaSeq 6000 | Celda de flujo SP (2 carriles) | PE250 | Celda de flujo Carril único Carril parcial | 325-400 M lecturas/carril |
| Celda de flujo S4 (4 carriles) | PE150 | Celda de flujo Carril único Carril parcial | ~800 Gb/carril |
Requisitos de muestra
| Cantidad de datos (X) | Concentración (qPCR/nM) | Volumen | |
| Secuenciación de carriles parciales
| X ≤ 10 GB | ≥ 1 nM | ≥ 25 µl |
| 10 GB < X ≤ 50 GB | ≥ 2 nM | ≥ 25 µl | |
| 50 GB < X ≤ 100 GB | ≥ 3 nM | ≥ 25 µl | |
| X > 100GB | ≥ 4 nM | ≥ 25 µl | |
| Secuenciación de carriles | Por carril | ≥ 1,5 nM / conjunto de bibliotecas | ≥ 25 μl/grupo de biblioteca |
Además de la concentración y la cantidad total, también se requiere un patrón de picos adecuado.
Nota: La secuenciación de carriles de bibliotecas de baja diversidad requiere un aumento de PhiX para garantizar una llamada base sólida.
Recomendamos enviar bibliotecas preagrupadas como muestras. Si necesita que BMKGENE realice la agrupación de bibliotecas, consulte
los requisitos de la biblioteca para la secuenciación parcial de carriles.
Tamaño de la biblioteca (mapa de picos)
El pico principal debe estar entre 300 y 450 pb.
Las bibliotecas deben tener un único pico principal, sin contaminación del adaptador ni dímeros de cebador.
Comuníquese con nosotros si sus muestras no cumplen con los requisitos del material de partida.
Flujo de trabajo del servicio
control de calidad de la biblioteca
Secuenciación
Control de calidad de datos
Entrega del proyecto
Informe de control de calidad de la biblioteca
Se proporciona un informe sobre la calidad de la biblioteca antes de la secuenciación, la evaluación de la cantidad y la fragmentación de la biblioteca.
Informe de control de calidad de secuenciación
Tabla 1. Estadísticas sobre datos de secuenciación.
| ID de muestra | BMKID | Lecturas crudas | Datos brutos (pb) | Lecturas limpias (%) | Q20(%) | Q30(%) | CG(%) |
| C_01 | BMK_01 | 22.870.120 | 6.861.036.000 | 96,48 | 99,14 | 94,85 | 36,67 |
| C_02 | BMK_02 | 14.717.867 | 4.415.360.100 | 96.00 | 98,95 | 93,89 | 37.08 |
Figura 1. Distribución de calidad a lo largo de lecturas en cada muestra
Figura 2. Distribución del contenido base
Figura 3. Distribución de contenidos leídos en datos de secuenciación.
